Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z2

CALCOCO1, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO1Q9P1Z2 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 KCNIP2-203ENST00000348850 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 RBMS1-201ENST00000348849 4273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 TRAPPC9-201ENST00000389328 4474 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 IFFO1-206ENST00000465801 2850 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 AGPAT3-202ENST00000327505 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 AGPAT3-204ENST00000398061 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 TJAP1-201ENST00000259751 2720 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 COL20A1-203ENST00000422202 8097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 ITGA2B-201ENST00000262407 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 WTH3DI-201ENST00000623617 3032 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 PLA2G4F-202ENST00000397272 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 RNF43-208ENST00000584437 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 TOX2-203ENST00000372999 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 SESN3-203ENST00000536441 9558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 ATG5-202ENST00000360666 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 BCRP2-203ENST00000461808 1832 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 KLHL13-209ENST00000545703 3322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC28A1-203ENST00000394573 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 ITGB2-205ENST00000397850 3178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 NUB1-201ENST00000413040 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 NHEJ1-201ENST00000356853 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 ARAP1-204ENST00000393609 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 PAM-207ENST00000455264 2898 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 DUOX2-205ENST00000603300 6345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 PTPRH-202ENST00000376350 3877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 ACO2-201ENST00000216254 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 NCSTN-201ENST00000294785 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 DHX30-215ENST00000619982 3574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC6A10P-201ENST00000330048 3846 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 PDZD4-209ENST00000544474 3418 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 CSPG4P11-201ENST00000560634 4910 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 CSF2RB-203ENST00000406230 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 SRSF1-205ENST00000582730 3117 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 TNNI1-202ENST00000361379 5413 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 CTCFL-218ENST00000608440 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 AOC3-201ENST00000308423 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 CFAP43-201ENST00000278064 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CALCOCO1Q9P1Z2 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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