Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
COG3Q96JB2 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
COG3Q96JB2 FAM9B-201ENST00000327220 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
COG3Q96JB2 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
COG3Q96JB2 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
COG3Q96JB2 PPHLN1-223ENST00000610488 1521 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
COG3Q96JB2 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
COG3Q96JB2 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
COG3Q96JB2 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
COG3Q96JB2 LINC00637-201ENST00000556586 2056 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
COG3Q96JB2 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
COG3Q96JB2 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
COG3Q96JB2 PDLIM5-203ENST00000359265 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
COG3Q96JB2 CDRT15L2-201ENST00000399044 1048 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
COG3Q96JB2 AC116609.2-201ENST00000431542 256 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
COG3Q96JB2 PGK1P2-201ENST00000431702 1214 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
COG3Q96JB2 NME6-208ENST00000435684 599 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
COG3Q96JB2 ZNF877P-201ENST00000437614 612 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
COG3Q96JB2 AC019118.1-201ENST00000454530 435 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
COG3Q96JB2 AC245884.1-201ENST00000457113 529 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
COG3Q96JB2 RHOH-206ENST00000505618 1225 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
COG3Q96JB2 SAA2-206ENST00000530400 323 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
COG3Q96JB2 NAV1-210ENST00000593583 726 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
COG3Q96JB2 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
COG3Q96JB2 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
COG3Q96JB2 DDX46-212ENST00000628477 1584 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
COG3Q96JB2 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
COG3Q96JB2 MKRN2-203ENST00000448482 1679 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
COG3Q96JB2 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
COG3Q96JB2 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
COG3Q96JB2 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
COG3Q96JB2 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
COG3Q96JB2 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
COG3Q96JB2 AL513497.1-201ENST00000624273 2083 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
COG3Q96JB2 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
COG3Q96JB2 AC007491.1-201ENST00000637560 1306 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
COG3Q96JB2 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
COG3Q96JB2 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COG3Q96JB2 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COG3Q96JB2 PDCD6IPP2-206ENST00000566178 3351 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
COG3Q96JB2 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
COG3Q96JB2 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COG3Q96JB2 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
COG3Q96JB2 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COG3Q96JB2 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COG3Q96JB2 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
COG3Q96JB2 IFITM1-201ENST00000328221 844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
COG3Q96JB2 IFITM1-202ENST00000408968 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COG3Q96JB2 OR7E155P-201ENST00000412208 1014 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
COG3Q96JB2 BX248123.1-201ENST00000429070 606 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
COG3Q96JB2 FAU-202ENST00000434372 533 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
COG3Q96JB2 AC112250.1-201ENST00000504640 745 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
COG3Q96JB2 MEF2C-AS2-201ENST00000510274 463 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
COG3Q96JB2 CLNS1A-211ENST00000532069 898 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
COG3Q96JB2 AC068675.1-201ENST00000588996 561 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
COG3Q96JB2 AC006547.3-201ENST00000600090 583 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
COG3Q96JB2 KF455155.1-201ENST00000604493 303 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
COG3Q96JB2 GGNBP1-204ENST00000613113 887 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
COG3Q96JB2 CRABP2-204ENST00000621784 1033 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
COG3Q96JB2 IDH3A-224ENST00000629769 114 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
COG3Q96JB2 AC064850.1-201ENST00000413279 1398 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
COG3Q96JB2 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COG3Q96JB2 ABLIM2-215ENST00000545242 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
COG3Q96JB2 DANT2-201ENST00000430756 2079 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
COG3Q96JB2 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
COG3Q96JB2 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COG3Q96JB2 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COG3Q96JB2 GNAI2-203ENST00000422163 2407 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
COG3Q96JB2 TBC1D3P2-201ENST00000339120 1513 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
COG3Q96JB2 KLKP1-203ENST00000600104 1532 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COG3Q96JB2 UBE2L5P-202ENST00000635918 1513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
COG3Q96JB2 FAHD2B-201ENST00000272610 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COG3Q96JB2 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COG3Q96JB2 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
COG3Q96JB2 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COG3Q96JB2 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
COG3Q96JB2 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
COG3Q96JB2 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
COG3Q96JB2 KAT7-204ENST00000454930 1774 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
COG3Q96JB2 SETMAR-205ENST00000425863 1657 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
COG3Q96JB2 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COG3Q96JB2 ERICH1-206ENST00000522706 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
COG3Q96JB2 AAR2-203ENST00000397286 1466 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
COG3Q96JB2 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COG3Q96JB2 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
COG3Q96JB2 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COG3Q96JB2 VPS28-201ENST00000292510 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COG3Q96JB2 IFNLR1-204ENST00000374419 953 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
COG3Q96JB2 VPS28-202ENST00000377348 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COG3Q96JB2 TMEM14B-201ENST00000379530 787 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
COG3Q96JB2 TNNI2-202ENST00000381905 706 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
COG3Q96JB2 TNNI2-203ENST00000381906 745 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
COG3Q96JB2 TNNI2-204ENST00000381911 743 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
COG3Q96JB2 CHEK2-203ENST00000382565 696 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
COG3Q96JB2 AF274858.1-201ENST00000406288 372 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
COG3Q96JB2 SLC12A9-AS1-201ENST00000412754 369 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
COG3Q96JB2 HNRNPA1P21-201ENST00000424115 961 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
COG3Q96JB2 AL662797.1-201ENST00000442852 799 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
COG3Q96JB2 TCEAL4-206ENST00000468024 1135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COG3Q96JB2 TLN2-202ENST00000472902 2116 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.4 ms