Protein–RNA interactions for Protein: Q93084

ATP2A3, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A3Q93084 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ATP2A3Q93084 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ATP2A3Q93084 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ATP2A3Q93084 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ATP2A3Q93084 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ATP2A3Q93084 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ATP2A3Q93084 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ATP2A3Q93084 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ATP2A3Q93084 DUSP22-213ENST00000605035 1231 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ATP2A3Q93084 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
ATP2A3Q93084 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ATP2A3Q93084 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
ATP2A3Q93084 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ATP2A3Q93084 R3HDM2-204ENST00000402412 4372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ATP2A3Q93084 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ATP2A3Q93084 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ATP2A3Q93084 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ATP2A3Q93084 UBE3A-228ENST00000638155 9131 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ATP2A3Q93084 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ATP2A3Q93084 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ATP2A3Q93084 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ATP2A3Q93084 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ATP2A3Q93084 SYNGAP1-208ENST00000629380 9862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ATP2A3Q93084 NPC1-201ENST00000269228 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ATP2A3Q93084 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ATP2A3Q93084 MGRN1-203ENST00000415496 6405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ATP2A3Q93084 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ATP2A3Q93084 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ATP2A3Q93084 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ATP2A3Q93084 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ATP2A3Q93084 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ATP2A3Q93084 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATP2A3Q93084 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATP2A3Q93084 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATP2A3Q93084 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATP2A3Q93084 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATP2A3Q93084 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATP2A3Q93084 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATP2A3Q93084 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATP2A3Q93084 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATP2A3Q93084 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATP2A3Q93084 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATP2A3Q93084 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
ATP2A3Q93084 GSE1-202ENST00000393243 7140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATP2A3Q93084 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATP2A3Q93084 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATP2A3Q93084 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATP2A3Q93084 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATP2A3Q93084 CHD5-201ENST00000262450 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATP2A3Q93084 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATP2A3Q93084 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATP2A3Q93084 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
ATP2A3Q93084 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
ATP2A3Q93084 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATP2A3Q93084 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
ATP2A3Q93084 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATP2A3Q93084 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATP2A3Q93084 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
ATP2A3Q93084 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATP2A3Q93084 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATP2A3Q93084 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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ATP2A3Q93084 AC010422.5-201ENST00000597961 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATP2A3Q93084 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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ATP2A3Q93084 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
ATP2A3Q93084 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
ATP2A3Q93084 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
ATP2A3Q93084 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
ATP2A3Q93084 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATP2A3Q93084 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATP2A3Q93084 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATP2A3Q93084 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATP2A3Q93084 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATP2A3Q93084 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATP2A3Q93084 TMEM245-201ENST00000374586 7980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATP2A3Q93084 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
ATP2A3Q93084 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATP2A3Q93084 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATP2A3Q93084 SRGAP3-201ENST00000360413 8415 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATP2A3Q93084 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATP2A3Q93084 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATP2A3Q93084 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATP2A3Q93084 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATP2A3Q93084 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATP2A3Q93084 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATP2A3Q93084 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATP2A3Q93084 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATP2A3Q93084 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
ATP2A3Q93084 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATP2A3Q93084 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATP2A3Q93084 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATP2A3Q93084 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATP2A3Q93084 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATP2A3Q93084 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
ATP2A3Q93084 PBRM1-204ENST00000394830 5071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATP2A3Q93084 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATP2A3Q93084 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATP2A3Q93084 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATP2A3Q93084 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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