Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPR1

ETFRF1, Electron transfer flavoprotein regulatory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 90 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETFRF1Q6IPR1 ZNF606-201ENST00000341164 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ETFRF1Q6IPR1 MYO18B-202ENST00000407587 8090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ETFRF1Q6IPR1 ABL2-204ENST00000502732 12144 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ETFRF1Q6IPR1 SNHG20-202ENST00000434411 2143 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ETFRF1Q6IPR1 ITGA3-201ENST00000007722 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
ETFRF1Q6IPR1 FOXN3-201ENST00000261302 2542 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
ETFRF1Q6IPR1 TMEM147-AS1-205ENST00000590717 3300 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ETFRF1Q6IPR1 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ETFRF1Q6IPR1 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
ETFRF1Q6IPR1 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
ETFRF1Q6IPR1 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
ETFRF1Q6IPR1 ABCD1P2-201ENST00000429313 1601 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
ETFRF1Q6IPR1 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
ETFRF1Q6IPR1 SNX19-211ENST00000533214 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ETFRF1Q6IPR1 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ETFRF1Q6IPR1 AL031714.1-202ENST00000568106 3107 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
ETFRF1Q6IPR1 DNMT1-201ENST00000340748 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ETFRF1Q6IPR1 AGBL2-205ENST00000528244 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
ETFRF1Q6IPR1 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ETFRF1Q6IPR1 CDCA7-203ENST00000410019 1488 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
ETFRF1Q6IPR1 DYSF-206ENST00000409744 6564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ETFRF1Q6IPR1 DYSF-209ENST00000410041 6594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ETFRF1Q6IPR1 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ETFRF1Q6IPR1 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
ETFRF1Q6IPR1 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
ETFRF1Q6IPR1 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
ETFRF1Q6IPR1 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ETFRF1Q6IPR1 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ETFRF1Q6IPR1 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ETFRF1Q6IPR1 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
ETFRF1Q6IPR1 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
ETFRF1Q6IPR1 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
ETFRF1Q6IPR1 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
ETFRF1Q6IPR1 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
ETFRF1Q6IPR1 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
ETFRF1Q6IPR1 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
ETFRF1Q6IPR1 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
ETFRF1Q6IPR1 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
ETFRF1Q6IPR1 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
ETFRF1Q6IPR1 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
ETFRF1Q6IPR1 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
ETFRF1Q6IPR1 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
ETFRF1Q6IPR1 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
ETFRF1Q6IPR1 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
ETFRF1Q6IPR1 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
ETFRF1Q6IPR1 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC11.28□□□□□ -0.6
ETFRF1Q6IPR1 FXYD6-202ENST00000524656 1033 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
ETFRF1Q6IPR1 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
ETFRF1Q6IPR1 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
ETFRF1Q6IPR1 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
ETFRF1Q6IPR1 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
ETFRF1Q6IPR1 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ETFRF1Q6IPR1 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
ETFRF1Q6IPR1 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
ETFRF1Q6IPR1 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ETFRF1Q6IPR1 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ETFRF1Q6IPR1 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
ETFRF1Q6IPR1 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
ETFRF1Q6IPR1 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
ETFRF1Q6IPR1 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ETFRF1Q6IPR1 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
ETFRF1Q6IPR1 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
ETFRF1Q6IPR1 HFE-202ENST00000317896 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ETFRF1Q6IPR1 INMT-201ENST00000013222 2559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ETFRF1Q6IPR1 SPATA20-227ENST00000634597 2587 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
ETFRF1Q6IPR1 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
ETFRF1Q6IPR1 KIAA0895-203ENST00000338533 4132 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ETFRF1Q6IPR1 HERC6-202ENST00000273960 3473 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ETFRF1Q6IPR1 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ETFRF1Q6IPR1 AL139193.2-201ENST00000553712 1954 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ETFRF1Q6IPR1 EIF3CL-201ENST00000380876 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ETFRF1Q6IPR1 HEXA-201ENST00000268097 5252 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ETFRF1Q6IPR1 AC026992.2-203ENST00000563004 2419 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
ETFRF1Q6IPR1 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
ETFRF1Q6IPR1 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ETFRF1Q6IPR1 MEP1A-201ENST00000230588 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ETFRF1Q6IPR1 RNF217-210ENST00000521654 11325 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
ETFRF1Q6IPR1 ARHGAP45-203ENST00000543365 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
ETFRF1Q6IPR1 PLB1-201ENST00000327757 5107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ETFRF1Q6IPR1 NCLN-201ENST00000246117 4005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ETFRF1Q6IPR1 KLB-201ENST00000257408 6082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ETFRF1Q6IPR1 KIF12-201ENST00000374118 2001 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ETFRF1Q6IPR1 PLEKHB2-205ENST00000409279 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
ETFRF1Q6IPR1 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
ETFRF1Q6IPR1 MAP2K3-214ENST00000613338 2029 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ETFRF1Q6IPR1 GRM2-202ENST00000395052 3151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
ETFRF1Q6IPR1 PCDHGA6-201ENST00000517434 4775 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ETFRF1Q6IPR1 PPP6C-203ENST00000451402 4349 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
ETFRF1Q6IPR1 PGAP2-202ENST00000300730 1843 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ETFRF1Q6IPR1 CCT6B-201ENST00000314144 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ETFRF1Q6IPR1 PGAP2-203ENST00000396986 1837 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
ETFRF1Q6IPR1 AC021218.1-201ENST00000377722 2536 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
ETFRF1Q6IPR1 HMGCL-203ENST00000374490 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
ETFRF1Q6IPR1 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
ETFRF1Q6IPR1 SGK1-220ENST00000524929 2594 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
ETFRF1Q6IPR1 RALGPS1-201ENST00000259351 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
ETFRF1Q6IPR1 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
ETFRF1Q6IPR1 BIVM-ERCC5-204ENST00000639132 5195 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
ETFRF1Q6IPR1 TNFAIP3-206ENST00000612899 4735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
ETFRF1Q6IPR1 SPINT1-201ENST00000344051 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms