Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y2

PKDCC, Extracellular tyrosine-protein kinase PKDCC, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCCQ504Y2 AP003068.3-201ENST00000527789 175 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PKDCCQ504Y2 CR383656.3-201ENST00000551315 183 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PKDCCQ504Y2 EMC4-208ENST00000559078 599 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PKDCCQ504Y2 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PKDCCQ504Y2 AC020659.1-202ENST00000564432 531 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PKDCCQ504Y2 RN7SL556P-201ENST00000582856 298 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PKDCCQ504Y2 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PKDCCQ504Y2 STAG3L1-204ENST00000619870 1192 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PKDCCQ504Y2 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PKDCCQ504Y2 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PKDCCQ504Y2 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PKDCCQ504Y2 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PKDCCQ504Y2 STX3-207ENST00000633708 3111 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PKDCCQ504Y2 MARCH9-202ENST00000548358 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PKDCCQ504Y2 DNAJB6-204ENST00000429029 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PKDCCQ504Y2 FGD4-203ENST00000472289 1629 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PKDCCQ504Y2 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PKDCCQ504Y2 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PKDCCQ504Y2 WDR81-205ENST00000437219 3184 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PKDCCQ504Y2 AC024075.2-201ENST00000598112 1473 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PKDCCQ504Y2 RTN3-210ENST00000540798 3124 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PKDCCQ504Y2 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PKDCCQ504Y2 TRO-225ENST00000622017 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PKDCCQ504Y2 SH2D7-202ENST00000409568 2162 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PKDCCQ504Y2 PPP2R2C-204ENST00000506140 1780 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PKDCCQ504Y2 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PKDCCQ504Y2 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PKDCCQ504Y2 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PKDCCQ504Y2 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PKDCCQ504Y2 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PKDCCQ504Y2 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PKDCCQ504Y2 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PKDCCQ504Y2 ELFN1-AS1-201ENST00000415399 636 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PKDCCQ504Y2 KRT18P62-201ENST00000446618 1287 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PKDCCQ504Y2 MUTYH-231ENST00000488731 740 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PKDCCQ504Y2 HNRNPA1P23-201ENST00000491091 1133 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PKDCCQ504Y2 AC100858.1-201ENST00000514059 1228 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PKDCCQ504Y2 NUDCD2-202ENST00000517501 448 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PKDCCQ504Y2 CD44-224ENST00000526669 870 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PKDCCQ504Y2 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PKDCCQ504Y2 COA4-204ENST00000541455 1038 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PKDCCQ504Y2 TMEM202-AS1-201ENST00000562573 723 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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PKDCCQ504Y2 AC068675.1-201ENST00000588996 561 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PKDCCQ504Y2 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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PKDCCQ504Y2 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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PKDCCQ504Y2 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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PKDCCQ504Y2 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PKDCCQ504Y2 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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PKDCCQ504Y2 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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PKDCCQ504Y2 GSTZ1-210ENST00000554279 795 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PKDCCQ504Y2 NAA38-204ENST00000575208 529 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PKDCCQ504Y2 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PKDCCQ504Y2 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PKDCCQ504Y2 SMIM11B-202ENST00000619874 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PKDCCQ504Y2 EFEMP1-201ENST00000355426 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PKDCCQ504Y2 ZNF277-201ENST00000361822 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PKDCCQ504Y2 CNTD1-204ENST00000588408 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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