Protein–RNA interactions for Protein: Q04837

SSBP1, Single-stranded DNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP1Q04837 MRPS16-202ENST00000372945 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
SSBP1Q04837 KIZ-208ENST00000616848 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
SSBP1Q04837 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
SSBP1Q04837 HNRNPDL-207ENST00000614627 3968 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
SSBP1Q04837 CYP11B1-203ENST00000377675 2280 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
SSBP1Q04837 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
SSBP1Q04837 GSTM3-201ENST00000256594 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
SSBP1Q04837 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
SSBP1Q04837 TTC39B-201ENST00000297615 3053 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
SSBP1Q04837 GUCY2EP-203ENST00000531117 1918 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
SSBP1Q04837 AC104590.1-202ENST00000558368 1921 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
SSBP1Q04837 HPSE2-202ENST00000370549 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
SSBP1Q04837 SCN2B-201ENST00000278947 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
SSBP1Q04837 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
SSBP1Q04837 PER1-202ENST00000354903 3115 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
SSBP1Q04837 CACNA1C-211ENST00000399617 7482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
SSBP1Q04837 TUBB2A-201ENST00000333628 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SSBP1Q04837 DUSP11-202ENST00000443070 2175 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SSBP1Q04837 AP2A2-202ENST00000448903 4575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SSBP1Q04837 LHCGR-201ENST00000294954 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SSBP1Q04837 PDE2A-218ENST00000540345 3027 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SSBP1Q04837 KCNJ11-201ENST00000339994 2801 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
SSBP1Q04837 AC011700.1-201ENST00000610409 2627 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
SSBP1Q04837 ZNF133-201ENST00000316358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SSBP1Q04837 C12orf76-205ENST00000548191 2204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
SSBP1Q04837 BEST1-208ENST00000534553 1829 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
SSBP1Q04837 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
SSBP1Q04837 TMOD1-201ENST00000259365 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SSBP1Q04837 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
SSBP1Q04837 VASH1-AS1-202ENST00000556072 1684 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
SSBP1Q04837 TMC5-204ENST00000541464 3581 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
SSBP1Q04837 TGM7-201ENST00000452443 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SSBP1Q04837 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SSBP1Q04837 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SSBP1Q04837 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SSBP1Q04837 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
SSBP1Q04837 LMO1-201ENST00000335790 1279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SSBP1Q04837 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
SSBP1Q04837 PDLIM5-203ENST00000359265 1189 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SSBP1Q04837 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SSBP1Q04837 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SSBP1Q04837 NPPA-202ENST00000376480 855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SSBP1Q04837 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SSBP1Q04837 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SSBP1Q04837 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SSBP1Q04837 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
SSBP1Q04837 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
SSBP1Q04837 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
SSBP1Q04837 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SSBP1Q04837 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
SSBP1Q04837 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
SSBP1Q04837 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
SSBP1Q04837 LMO1-204ENST00000534484 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
SSBP1Q04837 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
SSBP1Q04837 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
SSBP1Q04837 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
SSBP1Q04837 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SSBP1Q04837 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC11.79□□□□□ -0.52
SSBP1Q04837 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
SSBP1Q04837 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
SSBP1Q04837 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
SSBP1Q04837 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
SSBP1Q04837 BTBD9-206ENST00000481247 8525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
SSBP1Q04837 AXIN2-209ENST00000618960 4060 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
SSBP1Q04837 AL358334.2-201ENST00000553648 4714 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
SSBP1Q04837 TMPRSS13-202ENST00000445164 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SSBP1Q04837 ITGA3-201ENST00000007722 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
SSBP1Q04837 IKZF1-206ENST00000359197 3487 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SSBP1Q04837 RGS16-201ENST00000367558 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SSBP1Q04837 PRR3-201ENST00000376557 1797 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
SSBP1Q04837 DUSP14-205ENST00000614411 2207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
SSBP1Q04837 SEC14L5-201ENST00000251170 6459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SSBP1Q04837 DNAJC30-201ENST00000395176 2485 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
SSBP1Q04837 SRP72-205ENST00000510663 2473 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SSBP1Q04837 FAM227B-212ENST00000561064 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SSBP1Q04837 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
SSBP1Q04837 WDR81-205ENST00000437219 3184 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
SSBP1Q04837 URGCP-201ENST00000336086 5658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SSBP1Q04837 GUCY1B3-202ENST00000502959 2255 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
SSBP1Q04837 ARMCX6-201ENST00000361910 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SSBP1Q04837 MOG-225ENST00000431798 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
SSBP1Q04837 RIN2-202ENST00000440354 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SSBP1Q04837 SIRPA-204ENST00000622179 4570 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
SSBP1Q04837 GPR12-202ENST00000405846 4850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SSBP1Q04837 SCN8A-202ENST00000355133 5820 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SSBP1Q04837 CACNA1G-225ENST00000512389 6837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SSBP1Q04837 CHIAP2-201ENST00000369743 2829 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
SSBP1Q04837 TVP23C-CDRT4-203ENST00000522212 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
SSBP1Q04837 AC010336.1-201ENST00000539278 4739 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
SSBP1Q04837 CCDC178-201ENST00000300227 3087 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
SSBP1Q04837 MFSD8-241ENST00000641686 4991 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
SSBP1Q04837 SLC37A3-201ENST00000326232 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SSBP1Q04837 ACACA-237ENST00000616317 9961 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SSBP1Q04837 TMEM182-202ENST00000409528 3112 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SSBP1Q04837 PIGG-217ENST00000509768 3121 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SSBP1Q04837 TRIM21-201ENST00000254436 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SSBP1Q04837 PHB-215ENST00000617874 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
SSBP1Q04837 LINC01209-201ENST00000451289 2400 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SSBP1Q04837 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SSBP1Q04837 LINC01649-202ENST00000634255 1743 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.1 ms