Protein–RNA interactions for Protein: P83916

CBX1, Chromobox protein homolog 1, humanhuman

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Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P83916 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CBX1P83916 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CBX1P83916 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CBX1P83916 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CBX1P83916 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CBX1P83916 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CBX1P83916 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CBX1P83916 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CBX1P83916 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CBX1P83916 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CBX1P83916 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CBX1P83916 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CBX1P83916 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CBX1P83916 ATP1B3-201ENST00000286371 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CBX1P83916 PCBP1-AS1-227ENST00000435880 2386 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CBX1P83916 NUP62-201ENST00000352066 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CBX1P83916 POM121L9P-201ENST00000414583 5018 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CBX1P83916 FBF1-212ENST00000636174 3626 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CBX1P83916 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CBX1P83916 TMEM56-201ENST00000370203 6822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CBX1P83916 TREH-202ENST00000397925 1718 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CBX1P83916 STX16-205ENST00000361830 4318 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CBX1P83916 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CBX1P83916 ACACA-237ENST00000616317 9961 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CBX1P83916 RAB43-205ENST00000393308 4193 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CBX1P83916 AKAP13-201ENST00000361243 9468 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CBX1P83916 ATAT1-205ENST00000376483 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CBX1P83916 TRMT10B-203ENST00000377754 1881 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CBX1P83916 SPATA13-205ENST00000409126 2111 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CBX1P83916 GPR17-206ENST00000544369 2598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CBX1P83916 ARSG-209ENST00000621439 2599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CBX1P83916 KIR3DL1-201ENST00000326542 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CBX1P83916 RABGAP1L-207ENST00000367690 1815 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CBX1P83916 ETFDH-206ENST00000511912 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CBX1P83916 NLRC3-202ENST00000359128 6401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CBX1P83916 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CBX1P83916 ARID4A-202ENST00000355431 5891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CBX1P83916 LINC01973-201ENST00000374983 4678 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CBX1P83916 FAM157A-203ENST00000634862 6083 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CBX1P83916 ARSG-201ENST00000448504 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CBX1P83916 GPR132-201ENST00000329797 3660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CBX1P83916 PIGV-202ENST00000374145 2713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CBX1P83916 ACOXL-202ENST00000389811 2714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CBX1P83916 MARK3-201ENST00000216288 2911 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CBX1P83916 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CBX1P83916 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CBX1P83916 EMP1-203ENST00000431267 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CBX1P83916 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CBX1P83916 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CBX1P83916 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CBX1P83916 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CBX1P83916 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CBX1P83916 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CBX1P83916 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CBX1P83916 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CBX1P83916 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CBX1P83916 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CBX1P83916 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CBX1P83916 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CBX1P83916 PLEKHG6-204ENST00000449001 3111 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CBX1P83916 SIN3A-202ENST00000394947 6737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CBX1P83916 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CBX1P83916 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CBX1P83916 PLEKHG3-204ENST00000484731 3001 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CBX1P83916 MVK-213ENST00000625889 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CBX1P83916 MCCC2-201ENST00000340941 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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CBX1P83916 VPS33B-201ENST00000333371 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CBX1P83916 BLZF1-201ENST00000329281 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CBX1P83916 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CBX1P83916 UCK1-202ENST00000372210 2051 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CBX1P83916 PHF8-201ENST00000322659 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CBX1P83916 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CBX1P83916 MYO9B-201ENST00000397274 7532 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CBX1P83916 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CBX1P83916 ZFC3H1-201ENST00000378743 7285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CBX1P83916 ABI1-203ENST00000376137 3467 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CBX1P83916 DRD3-203ENST00000460779 1557 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CBX1P83916 KCNAB2-201ENST00000164247 4273 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CBX1P83916 FERMT1-204ENST00000536936 3229 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CBX1P83916 SPTB-202ENST00000389720 6321 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CBX1P83916 AC037459.3-201ENST00000521025 2750 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
CBX1P83916 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CBX1P83916 FLNA-204ENST00000369856 8241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CBX1P83916 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CBX1P83916 DNAJC3-202ENST00000602402 5591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CBX1P83916 DGCR5-203ENST00000438934 5492 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CBX1P83916 RPH3A-202ENST00000415485 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CBX1P83916 PAPLN-208ENST00000555445 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CBX1P83916 C15orf40-201ENST00000304177 11244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CBX1P83916 IQCK-202ENST00000320394 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CBX1P83916 RNF10-203ENST00000413266 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CBX1P83916 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CBX1P83916 RCC2P1-201ENST00000452257 1476 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
CBX1P83916 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CBX1P83916 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CBX1P83916 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CBX1P83916 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CBX1P83916 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CBX1P83916 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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