Protein–RNA interactions for Protein: P48230

TM4SF4, Transmembrane 4 L6 family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF4P48230 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 MAFTRR-201ENST00000562921 1859 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 TRIP12-205ENST00000409677 1507 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 CDC20P1-201ENST00000488829 1500 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 XRCC6-202ENST00000360079 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 TEPP-201ENST00000290871 1079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 TIMM23B-201ENST00000374098 1142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 AL357079.1-203ENST00000412378 494 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 MRPS16P3-201ENST00000415961 374 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 AL512422.2-201ENST00000426453 551 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 RPE-208ENST00000436630 1128 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 HNRNPA1P9-201ENST00000450624 950 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 AC234582.2-201ENST00000455788 568 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 RN7SL148P-201ENST00000467120 279 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 AL136360.2-201ENST00000502636 581 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 WISP1-205ENST00000519433 545 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 AC009646.2-202ENST00000524425 826 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 CCDC42-202ENST00000539522 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 AL121790.2-201ENST00000553425 379 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 PEBP1P1-201ENST00000554856 510 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 IGHV3OR16-11-201ENST00000565524 349 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 AC109597.2-201ENST00000569407 927 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 SNORD55-201ENST00000581525 80 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 UBA52-214ENST00000599595 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 C12orf45-205ENST00000622317 1078 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 CR392039.2-201ENST00000623182 509 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 CD74-201ENST00000009530 981 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 CNTNAP2-207ENST00000628930 1944 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 NRROS-201ENST00000328557 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 LRRFIP1-202ENST00000289175 3709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 LINC01535-206ENST00000592712 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 GAS6-AS2-201ENST00000608651 1952 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 CATSPERD-202ENST00000381624 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 PRY-201ENST00000303728 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 PRY2-201ENST00000303804 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 PRYP3-201ENST00000343584 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 SRSF9P1-201ENST00000399149 530 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 NR1I3-210ENST00000437437 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 AL359915.1-201ENST00000457719 898 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 AC007622.1-201ENST00000488371 535 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 ATP5L2-201ENST00000505920 799 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 AC092284.1-201ENST00000511386 1289 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 AL606834.1-201ENST00000553836 1169 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 AC106782.3-201ENST00000563429 258 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 MRPL34-206ENST00000602206 603 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 SNHG5-213ENST00000622963 753 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 AC020763.2-201ENST00000623155 1255 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 RPS9-213ENST00000626547 476 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 AC006511.4-201ENST00000631571 561 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 MIR941-1-201ENST00000636396 72 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 LINC00910-201ENST00000341011 2303 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 SRL-202ENST00000537996 1814 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 DDX46-212ENST00000628477 1584 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 DDX11L1-202ENST00000456328 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63 ms