Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 AC008982.2-201ENST00000600473 493 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 AL356417.2-202ENST00000608986 532 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 AC091769.1-201ENST00000619576 568 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 EIF3F-209ENST00000640290 372 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 APOBEC3D-202ENST00000427494 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 ENO2-201ENST00000229277 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 NFE2L1-218ENST00000583378 2051 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 AC245140.2-201ENST00000624054 1939 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 FTX-216ENST00000638985 1367 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 APOL5-201ENST00000249044 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 NSMCE1-201ENST00000361439 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 GGTLC4P-201ENST00000402176 664 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 AC061961.1-201ENST00000443901 432 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 RCC2P5-201ENST00000492126 1487 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 LINC00969-231ENST00000597482 1476 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 CSNK1G3-201ENST00000345990 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 RFX8-201ENST00000428343 1686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 LINC00637-201ENST00000556586 2056 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 TBC1D3E-201ENST00000621587 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 TLN2-202ENST00000472902 2116 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 HNF1B-204ENST00000617811 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 PCDHA5-203ENST00000614258 4248 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 DLGAP1-202ENST00000400145 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 ZNF493-208ENST00000599461 1769 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 SYBU-217ENST00000528331 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 CCL5-201ENST00000603197 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 EPB42-210ENST00000622454 2227 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 PGAP2-202ENST00000300730 1843 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 PGAP2-203ENST00000396986 1837 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 SNAPC2-206ENST00000597584 1413 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 GOLGA8IP-201ENST00000340249 1899 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 SMIM12-206ENST00000521580 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 OR2V1-201ENST00000329365 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 INO80C-202ENST00000334598 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 TMSB4X-202ENST00000380635 767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 HNRNPA1P2-207ENST00000432375 960 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 AC253536.3-201ENST00000444093 558 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 AC005486.1-201ENST00000466775 216 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 RN7SL564P-201ENST00000496309 250 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 AC090825.1-202ENST00000560059 665 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.4 ms