Protein–RNA interactions for Protein: P21579

SYT1, Synaptotagmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT1P21579 MEST-206ENST00000416162 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYT1P21579 AL021155.1-201ENST00000438808 2637 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SYT1P21579 HAL-202ENST00000538703 2637 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYT1P21579 RPUSD4-201ENST00000298317 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYT1P21579 COL18A1-AS1-201ENST00000397787 3425 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYT1P21579 C2-209ENST00000452323 1999 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYT1P21579 SPACA9-202ENST00000356311 2243 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYT1P21579 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYT1P21579 ALG6-202ENST00000371108 3371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYT1P21579 AC139795.2-201ENST00000499900 1751 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYT1P21579 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYT1P21579 MARK2-205ENST00000408948 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYT1P21579 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYT1P21579 TIPARP-201ENST00000295924 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYT1P21579 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYT1P21579 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYT1P21579 DHX16-201ENST00000376437 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYT1P21579 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYT1P21579 MATN1-AS1-201ENST00000414532 3925 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYT1P21579 CDK5RAP1-203ENST00000357886 2164 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYT1P21579 DPP8-201ENST00000300141 3139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYT1P21579 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYT1P21579 PPP1R8-203ENST00000373931 2651 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYT1P21579 SKA3-202ENST00000314759 2919 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYT1P21579 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYT1P21579 PCDHA2-202ENST00000520672 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYT1P21579 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYT1P21579 CHMP4C-201ENST00000297265 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYT1P21579 H3F3B-201ENST00000254810 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYT1P21579 VILL-201ENST00000283713 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYT1P21579 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYT1P21579 PSMB8-AS1-204ENST00000429600 996 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYT1P21579 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYT1P21579 SLC25A15P3-201ENST00000505530 290 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SYT1P21579 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYT1P21579 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYT1P21579 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SYT1P21579 DCST2-202ENST00000368424 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYT1P21579 MMD2-203ENST00000406755 2372 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYT1P21579 RAB37-204ENST00000392613 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYT1P21579 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYT1P21579 ARGLU1-203ENST00000400198 3390 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYT1P21579 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYT1P21579 GPA33-201ENST00000367868 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYT1P21579 LILRB3-201ENST00000245620 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYT1P21579 ERCC4-207ENST00000575156 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYT1P21579 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYT1P21579 ZNF277-201ENST00000361822 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYT1P21579 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYT1P21579 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SYT1P21579 SGSM3-201ENST00000248929 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYT1P21579 MAGED4-201ENST00000375626 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYT1P21579 DRD2-210ENST00000544518 2473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYT1P21579 AC004554.1-201ENST00000422830 1468 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SYT1P21579 RCC2P5-201ENST00000492126 1487 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SYT1P21579 SALL2-205ENST00000611430 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYT1P21579 Z97192.2-201ENST00000393264 2379 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYT1P21579 YIPF1-201ENST00000072644 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYT1P21579 TBC1D2-204ENST00000375066 3198 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYT1P21579 FAM71E2-201ENST00000424985 3191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYT1P21579 SECISBP2-201ENST00000339901 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYT1P21579 TJAP1-204ENST00000372449 2695 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYT1P21579 C8B-201ENST00000371237 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYT1P21579 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYT1P21579 RIMS1-218ENST00000522291 3876 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYT1P21579 CT62-203ENST00000566432 2822 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYT1P21579 AC007336.3-201ENST00000623886 2160 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SYT1P21579 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYT1P21579 MDH2-203ENST00000432020 1548 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYT1P21579 THPO-203ENST00000445696 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYT1P21579 GUCY1B3-204ENST00000505154 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYT1P21579 ELN-211ENST00000414324 3139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYT1P21579 PI4KB-203ENST00000368874 3934 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYT1P21579 LCOR-203ENST00000371097 4852 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYT1P21579 SIRT2-201ENST00000249396 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYT1P21579 CWC27-201ENST00000381070 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYT1P21579 SIRT2-204ENST00000392081 2062 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYT1P21579 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SYT1P21579 PDLIM5-203ENST00000359265 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYT1P21579 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYT1P21579 OAZ3-203ENST00000453029 729 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYT1P21579 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SYT1P21579 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYT1P21579 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYT1P21579 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYT1P21579 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SYT1P21579 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYT1P21579 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYT1P21579 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SYT1P21579 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYT1P21579 ZWILCH-203ENST00000535141 2206 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYT1P21579 RIN2-202ENST00000440354 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYT1P21579 POTEB3-201ENST00000611217 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYT1P21579 GGA1-201ENST00000325180 2528 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYT1P21579 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYT1P21579 RPGRIP1-202ENST00000400017 3940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYT1P21579 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYT1P21579 GMEB2-203ENST00000370077 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYT1P21579 ATF3-202ENST00000341491 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYT1P21579 VMP1-201ENST00000262291 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms