Protein–RNA interactions for Protein: P12271

RLBP1, Retinaldehyde-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLBP1P12271 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RLBP1P12271 TGM3-201ENST00000381458 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RLBP1P12271 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
RLBP1P12271 USP2-201ENST00000260187 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RLBP1P12271 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RLBP1P12271 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RLBP1P12271 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RLBP1P12271 ARMC5-201ENST00000268314 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
RLBP1P12271 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RLBP1P12271 PDK2-203ENST00000503176 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RLBP1P12271 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RLBP1P12271 BAK1-202ENST00000374467 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RLBP1P12271 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RLBP1P12271 LINC00969-231ENST00000597482 1476 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RLBP1P12271 USP49-201ENST00000373006 3177 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RLBP1P12271 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RLBP1P12271 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RLBP1P12271 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RLBP1P12271 PHKG1-201ENST00000297373 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RLBP1P12271 TTC39B-201ENST00000297615 3053 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RLBP1P12271 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RLBP1P12271 ALDOA-202ENST00000395240 1447 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RLBP1P12271 UBE2W-201ENST00000419880 2315 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RLBP1P12271 MOCS1-207ENST00000432280 1071 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RLBP1P12271 OAZ3-203ENST00000453029 729 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RLBP1P12271 AC108462.1-201ENST00000457467 850 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RLBP1P12271 COQ10BP2-201ENST00000513804 724 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
RLBP1P12271 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RLBP1P12271 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RLBP1P12271 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RLBP1P12271 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RLBP1P12271 PCDHB18P-202ENST00000526308 3197 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
RLBP1P12271 BCL2L1-203ENST00000376062 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RLBP1P12271 LINC01756-201ENST00000417651 2148 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RLBP1P12271 TP73-207ENST00000378290 1831 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RLBP1P12271 PHF10-206ENST00000621772 1651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RLBP1P12271 SCARB2-227ENST00000640957 3255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RLBP1P12271 RAB40A-202ENST00000372633 3126 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RLBP1P12271 PDHB-201ENST00000302746 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RLBP1P12271 PPP1R32-201ENST00000338608 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RLBP1P12271 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RLBP1P12271 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RLBP1P12271 CHMP7-201ENST00000313219 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RLBP1P12271 DSN1-201ENST00000373734 1915 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RLBP1P12271 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RLBP1P12271 RNASE7-201ENST00000298690 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RLBP1P12271 AAR2-203ENST00000397286 1466 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RLBP1P12271 ETNPPL-202ENST00000411864 2028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RLBP1P12271 BIN3-202ENST00000399977 1340 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RLBP1P12271 RBM15-204ENST00000617047 3284 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RLBP1P12271 ZNF568-201ENST00000333987 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RLBP1P12271 ADCY4-202ENST00000418030 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RLBP1P12271 GIPC3-201ENST00000322315 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RLBP1P12271 C12orf66-201ENST00000311915 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RLBP1P12271 NCSTN-201ENST00000294785 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RLBP1P12271 HERPUD1-204ENST00000439977 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RLBP1P12271 PIAS1-202ENST00000545237 2932 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RLBP1P12271 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RLBP1P12271 HPS1-215ENST00000613394 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RLBP1P12271 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RLBP1P12271 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RLBP1P12271 SUPT20HL1-201ENST00000436466 2618 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
RLBP1P12271 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RLBP1P12271 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RLBP1P12271 RANGRF-202ENST00000407006 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RLBP1P12271 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RLBP1P12271 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
RLBP1P12271 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RLBP1P12271 PRKCZ-AS1-202ENST00000444529 622 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RLBP1P12271 AC005077.3-201ENST00000449614 213 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
RLBP1P12271 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RLBP1P12271 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RLBP1P12271 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RLBP1P12271 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RLBP1P12271 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RLBP1P12271 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RLBP1P12271 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RLBP1P12271 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RLBP1P12271 AL356417.2-202ENST00000608986 532 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RLBP1P12271 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
RLBP1P12271 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RLBP1P12271 LINC00969-321ENST00000629990 806 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RLBP1P12271 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RLBP1P12271 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RLBP1P12271 IMMT-212ENST00000620815 1520 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RLBP1P12271 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RLBP1P12271 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RLBP1P12271 PTPRH-202ENST00000376350 3877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RLBP1P12271 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RLBP1P12271 HTR3E-205ENST00000436361 1371 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RLBP1P12271 TLE3-211ENST00000557997 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RLBP1P12271 AP001258.1-201ENST00000501817 2110 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RLBP1P12271 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RLBP1P12271 PIGC-202ENST00000367728 2630 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RLBP1P12271 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RLBP1P12271 ING4-201ENST00000341550 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RLBP1P12271 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RLBP1P12271 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RLBP1P12271 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RLBP1P12271 ATP1B3-201ENST00000286371 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.4 ms