Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC9.04□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC9.04□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC9.04□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 TNFAIP3-206ENST00000612899 4735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 ADGRG3-201ENST00000333493 2728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 XRCC6-201ENST00000359308 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 SIGLECL1-201ENST00000316401 1708 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 AGGF1P10-201ENST00000635005 2191 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 ADCYAP1R1-201ENST00000304166 6487 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 BMF-201ENST00000354670 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 ZMYND10-201ENST00000231749 2896 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 PHF21B-201ENST00000313237 3671 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 NDRG4-255ENST00000570248 3207 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 UNC5CL-201ENST00000244565 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 AMPD2-219ENST00000528667 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 ZNF236-202ENST00000320610 7124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 DUT-208ENST00000559540 1441 ntTSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 ZNF519-206ENST00000589498 2117 ntTSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 TMC8-201ENST00000318430 4411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 PPP4R3B-205ENST00000616288 4310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 PRKAB1-205ENST00000540121 1673 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 CYFIP2-219ENST00000616178 4210 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 DHX37-201ENST00000308736 4550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 SEC23A-201ENST00000307712 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 DHX34-201ENST00000328771 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 DSN1-201ENST00000373734 1915 ntTSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 NFATC2-203ENST00000414705 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 AP4M1-204ENST00000421755 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 CYP39A1-205ENST00000619708 2269 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 POLR1B-216ENST00000537335 4961 ntTSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 C21orf59-203ENST00000382549 2503 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 TESMIN-204ENST00000443940 3495 ntTSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 FAM167A-201ENST00000284486 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 C2-206ENST00000442278 2434 ntTSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 YPEL4-201ENST00000300022 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 BCCIP-202ENST00000299130 2337 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 PARP3-201ENST00000398755 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 GOPC-202ENST00000368498 4450 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 SLC22A2-202ENST00000366953 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 DUSP16-201ENST00000228862 3402 ntTSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 PRPF40B-209ENST00000548825 3307 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 DSTN-203ENST00000474024 1853 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC9.03□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 Z82188.2-201ENST00000419128 630 ntTSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 FAM212B-AS1-201ENST00000430373 2131 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC9.03□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC9.03□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC9.03□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.03□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC9.03□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC9.03□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 AC007216.2-201ENST00000562802 384 ntTSL 3 BASIC9.03□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC9.03□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 IL2RG-203ENST00000374202 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 LINC01907-201ENST00000415174 2609 ntTSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 RCBTB2-205ENST00000544492 2622 ntTSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 GFRA1-204ENST00000439649 9216 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 LIX1L-201ENST00000604000 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 Z98885.3-201ENST00000624882 1757 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 TRIM4-203ENST00000355947 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 TRAF6-202ENST00000526995 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms