Protein–RNA interactions for Protein: P0DO97

CCDC192, Coiled-coil domain-containing protein 192, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC192P0DO97 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC192P0DO97 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC192P0DO97 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC192P0DO97 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC192P0DO97 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC192P0DO97 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC192P0DO97 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC192P0DO97 GPNMB-203ENST00000409458 1673 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC192P0DO97 MAP7D2-202ENST00000379651 3930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC192P0DO97 SH2D3C-201ENST00000314830 3124 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC192P0DO97 DNMT3B-206ENST00000456297 2315 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC192P0DO97 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC192P0DO97 ADPRH-205ENST00000478927 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC192P0DO97 DISC1-206ENST00000366637 6848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC192P0DO97 NKX2-1-AS1-201ENST00000521292 1775 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC192P0DO97 ZBTB20-206ENST00000464560 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC192P0DO97 ADAMTS5-201ENST00000284987 9056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC192P0DO97 LHFPL2-201ENST00000380345 5043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC192P0DO97 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC192P0DO97 IL10-202ENST00000423557 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC192P0DO97 MAP3K12-203ENST00000547035 2944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC192P0DO97 FCHO1-221ENST00000597512 2934 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC192P0DO97 WDR81-205ENST00000437219 3184 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC192P0DO97 AC021218.1-201ENST00000377722 2536 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC192P0DO97 PEAR1-202ENST00000338302 4970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC192P0DO97 KCNS2-202ENST00000521839 4340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC192P0DO97 KLC4-203ENST00000394056 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC192P0DO97 MYADM-201ENST00000336967 3047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC192P0DO97 RBSN-207ENST00000476527 3005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC192P0DO97 B4GALT4-201ENST00000359213 2385 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC192P0DO97 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC192P0DO97 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC192P0DO97 RBL1-202ENST00000373664 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC192P0DO97 ZNF501-205ENST00000620116 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC192P0DO97 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC192P0DO97 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC192P0DO97 CYFIP2-219ENST00000616178 4210 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC192P0DO97 DHX37-201ENST00000308736 4550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC192P0DO97 HTR5A-201ENST00000287907 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC192P0DO97 AC022364.1-202ENST00000617468 2409 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC192P0DO97 MAP2K3-203ENST00000361818 2034 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC192P0DO97 BCAP29-201ENST00000005259 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC192P0DO97 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC192P0DO97 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC192P0DO97 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC192P0DO97 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC192P0DO97 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC192P0DO97 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC192P0DO97 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC192P0DO97 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC192P0DO97 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC192P0DO97 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC192P0DO97 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC192P0DO97 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC192P0DO97 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC192P0DO97 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC192P0DO97 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC192P0DO97 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC192P0DO97 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC192P0DO97 PTPRS-204ENST00000587303 6353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC192P0DO97 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC192P0DO97 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC192P0DO97 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC192P0DO97 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC192P0DO97 LINC00865-202ENST00000448963 4272 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC192P0DO97 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC192P0DO97 LARGE1-203ENST00000402320 3955 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC192P0DO97 PDE2A-218ENST00000540345 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC192P0DO97 ERLIN1-202ENST00000407654 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CCDC192P0DO97 WASHC1-201ENST00000442898 1827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CCDC192P0DO97 CDK5RAP1-203ENST00000357886 2164 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CCDC192P0DO97 LDLRAD4-203ENST00000399848 8633 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CCDC192P0DO97 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CCDC192P0DO97 ZNF239-205ENST00000535642 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CCDC192P0DO97 STAG3-206ENST00000426455 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CCDC192P0DO97 HPS3-201ENST00000296051 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC192P0DO97 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC192P0DO97 MAPKAPK5-206ENST00000550735 11349 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC192P0DO97 CYTH1-215ENST00000591455 3286 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC192P0DO97 LINC01756-201ENST00000417651 2148 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC192P0DO97 ZCCHC18-206ENST00000611638 2941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC192P0DO97 AL645937.6-201ENST00000641122 3727 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC192P0DO97 SLC39A6-204ENST00000590986 3003 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC192P0DO97 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC192P0DO97 NLRP13-201ENST00000342929 3132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC192P0DO97 MTSS1-201ENST00000325064 2777 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC192P0DO97 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC192P0DO97 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC192P0DO97 TRPC7-202ENST00000378459 2406 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC192P0DO97 PCDHA11-202ENST00000616325 3418 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC192P0DO97 FMO6P-201ENST00000236166 1620 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC192P0DO97 GJB1-201ENST00000361726 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC192P0DO97 AC244453.2-201ENST00000457996 3543 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC192P0DO97 MYO16-202ENST00000356711 6874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC192P0DO97 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC192P0DO97 SNCAIP-222ENST00000542191 2729 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC192P0DO97 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC192P0DO97 PPFIA4-202ENST00000295706 6395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC192P0DO97 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC192P0DO97 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms