Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 USP47-202ENST00000339865 7775 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 NSD2-206ENST00000382895 7827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 CELSR1-201ENST00000262738 11389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 SON-203ENST00000381679 7860 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 TBC1D27-202ENST00000424239 1573 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 INO80-202ENST00000401393 5991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 SMIM14-201ENST00000295958 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 NCF4-202ENST00000397147 1641 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 CX3CL1-204ENST00000565912 5796 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 HNRNPA1-201ENST00000330752 1294 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 ASNA1-201ENST00000357332 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 OR7E115P-201ENST00000382617 1024 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 KSR1-204ENST00000398988 7237 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 APOBEC3H-202ENST00000401756 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 MIR1227-201ENST00000408484 88 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 RBM14-204ENST00000409738 372 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 AC108734.2-201ENST00000420887 1069 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 FAM92A-202ENST00000423990 914 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 LINC02557-201ENST00000432249 477 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 AC092573.1-201ENST00000433054 884 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 PSMD4P1-201ENST00000433951 1109 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 SGO1-AS1-201ENST00000441442 499 ntTSL 4 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 AP001062.3-202ENST00000444409 619 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 MUTYH-231ENST00000488731 740 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 NSD1-211ENST00000511258 809 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 IGHV1-12-201ENST00000518307 205 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 AC011921.1-201ENST00000559739 557 ntTSL 4 BASIC11.25□□□□□ -0.61
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HOXA3O43365 AC132825.4-202ENST00000578792 434 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 AC011247.3-201ENST00000603297 438 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 CSAG3-203ENST00000638835 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 CSAG2-204ENST00000640702 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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HOXA3O43365 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 C12orf65-204ENST00000429587 1326 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 CCL18-201ENST00000616054 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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HOXA3O43365 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 SLC25A31-201ENST00000281154 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
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HOXA3O43365 NUP133-201ENST00000261396 5207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 CDH1-201ENST00000261769 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 GPRC5A-201ENST00000014914 7362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 AC004554.1-201ENST00000422830 1468 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 KCTD6-202ENST00000404589 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
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HOXA3O43365 GLIS3-201ENST00000324333 6667 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 KLHL9-201ENST00000359039 5710 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 LAMA3-202ENST00000313654 10661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
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