Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 TMEM78-201ENST00000323223 2175 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 CCNG2-202ENST00000395640 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 TRAPPC4-214ENST00000533632 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 MUC1-207ENST00000368392 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 MUC1-208ENST00000368393 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 LYPLA2-203ENST00000374503 868 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 MIR611-201ENST00000384869 67 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 DNM1P46-202ENST00000415963 882 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 AHCYP3-201ENST00000420053 1279 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 HDHD5-AS1-202ENST00000431923 616 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 AC092865.2-201ENST00000439409 971 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 MUC1-213ENST00000462215 1189 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 AC087071.1-201ENST00000469264 427 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 AC092910.2-201ENST00000491262 348 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 IGHVII-33-1-201ENST00000524010 280 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 AP003040.1-201ENST00000532044 1024 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 AC073896.3-201ENST00000546789 437 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 DTWD1-205ENST00000558653 1131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 RAB11B-205ENST00000601897 577 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 AC136475.7-201ENST00000602949 592 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 OR5L1-201ENST00000625203 1110 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 Z82244.1-201ENST00000631502 840 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 DNAJB8-201ENST00000319153 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 TMEM74B-201ENST00000381894 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 GNAI2-203ENST00000422163 2407 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 ZIK1-201ENST00000307468 2510 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 HLA-DQA1-201ENST00000343139 1591 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 FGF21-202ENST00000593756 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 GFI1B-202ENST00000372122 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 SPDYA-202ENST00000379579 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 LTA-213ENST00000418386 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 CNOT7-211ENST00000523917 1885 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 CSNK1E-201ENST00000359867 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 KRTAP1-5-201ENST00000361883 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 RN7SKP255-201ENST00000363442 313 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 RN7SKP203-201ENST00000363618 332 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 RN7SKP71-201ENST00000364558 318 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 7SK.1-201ENST00000365328 331 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 SPAG5-AS1-204ENST00000556050 871 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 RORA-AS1-202ENST00000558140 869 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 SLC9A3R2-204ENST00000563587 1037 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 SRRM2-AS1-204ENST00000573802 818 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 AC091132.6-201ENST00000586411 826 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 AC012593.1-214ENST00000586952 767 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 AC138150.1-201ENST00000589950 570 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 FAM90A28P-201ENST00000596881 489 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 HIST1H3B-201ENST00000621411 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 AL513478.2-202ENST00000621949 835 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 CCDC42-201ENST00000293845 1374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 ACTN1-205ENST00000538545 2813 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 XRN1-203ENST00000463916 2075 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 AL050341.2-201ENST00000567508 1541 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 GMPR2-206ENST00000557854 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 GPATCH2L-202ENST00000312858 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 PROK2-201ENST00000295619 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 PLA2G2A-202ENST00000400520 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 CFL1P6-201ENST00000400899 494 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 AL356653.1-201ENST00000402743 360 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 POLR2F-202ENST00000405557 560 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 DUX4L31-201ENST00000446466 1136 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ERVV-2B6SEH9 Z82249.1-201ENST00000453866 568 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms