Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB9

TFIP11, Tuftelin-interacting protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFIP11Q9UBB9 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TFIP11Q9UBB9 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TFIP11Q9UBB9 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TFIP11Q9UBB9 RTL5-202ENST00000609883 4105 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TFIP11Q9UBB9 NDRG4-236ENST00000566192 3265 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TFIP11Q9UBB9 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TFIP11Q9UBB9 RPGRIP1-202ENST00000400017 3940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TFIP11Q9UBB9 SPAST-201ENST00000315285 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TFIP11Q9UBB9 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TFIP11Q9UBB9 KCNIP1-210ENST00000636734 1613 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TFIP11Q9UBB9 DSN1-201ENST00000373734 1915 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TFIP11Q9UBB9 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TFIP11Q9UBB9 PSME4-202ENST00000404125 7099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TFIP11Q9UBB9 NTM-202ENST00000374786 3190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TFIP11Q9UBB9 IFT172-203ENST00000416524 1982 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TFIP11Q9UBB9 MGRN1-211ENST00000588994 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TFIP11Q9UBB9 L2HGDH-201ENST00000261699 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TFIP11Q9UBB9 GULP1-207ENST00000409843 2643 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TFIP11Q9UBB9 EML1-203ENST00000334192 4064 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TFIP11Q9UBB9 RTN4-202ENST00000337526 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TFIP11Q9UBB9 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TFIP11Q9UBB9 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TFIP11Q9UBB9 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TFIP11Q9UBB9 ISY1-RAB43-201ENST00000418265 4868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TFIP11Q9UBB9 BCL2L1-203ENST00000376062 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TFIP11Q9UBB9 AC020763.3-201ENST00000625095 2904 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TFIP11Q9UBB9 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TFIP11Q9UBB9 ELP2-221ENST00000542824 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TFIP11Q9UBB9 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TFIP11Q9UBB9 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TFIP11Q9UBB9 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TFIP11Q9UBB9 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TFIP11Q9UBB9 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TFIP11Q9UBB9 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TFIP11Q9UBB9 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TFIP11Q9UBB9 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TFIP11Q9UBB9 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TFIP11Q9UBB9 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TFIP11Q9UBB9 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TFIP11Q9UBB9 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TFIP11Q9UBB9 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TFIP11Q9UBB9 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TFIP11Q9UBB9 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TFIP11Q9UBB9 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TFIP11Q9UBB9 IFT81-201ENST00000242591 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TFIP11Q9UBB9 KLC4-203ENST00000394056 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TFIP11Q9UBB9 PDE4C-204ENST00000539010 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TFIP11Q9UBB9 RGL4-202ENST00000401461 2420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TFIP11Q9UBB9 NIT1-202ENST00000368008 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TFIP11Q9UBB9 DISC1-221ENST00000620189 6689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TFIP11Q9UBB9 UBA2-201ENST00000246548 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TFIP11Q9UBB9 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TFIP11Q9UBB9 RCBTB2-205ENST00000544492 2622 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TFIP11Q9UBB9 DYRK4-201ENST00000010132 1840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TFIP11Q9UBB9 AC002350.2-201ENST00000623894 1828 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TFIP11Q9UBB9 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TFIP11Q9UBB9 GTF2F1-201ENST00000394456 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TFIP11Q9UBB9 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TFIP11Q9UBB9 CNTLN-201ENST00000380641 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TFIP11Q9UBB9 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TFIP11Q9UBB9 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TFIP11Q9UBB9 EPN2-205ENST00000395626 2863 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TFIP11Q9UBB9 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TFIP11Q9UBB9 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TFIP11Q9UBB9 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TFIP11Q9UBB9 NACC2-202ENST00000371753 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TFIP11Q9UBB9 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TFIP11Q9UBB9 CDC20B-202ENST00000322374 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TFIP11Q9UBB9 PJA1-203ENST00000374583 2692 ntAPPRIS P4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TFIP11Q9UBB9 NSD2-203ENST00000382888 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TFIP11Q9UBB9 FAM71E2-201ENST00000424985 3191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TFIP11Q9UBB9 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TFIP11Q9UBB9 EWSAT1-201ENST00000415504 2214 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TFIP11Q9UBB9 ACIN1-204ENST00000397341 2738 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TFIP11Q9UBB9 AC016245.1-201ENST00000570335 3204 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TFIP11Q9UBB9 AC239809.3-201ENST00000599640 4266 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TFIP11Q9UBB9 VPS54-203ENST00000409558 4337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TFIP11Q9UBB9 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TFIP11Q9UBB9 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TFIP11Q9UBB9 NUDT2-202ENST00000379155 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TFIP11Q9UBB9 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TFIP11Q9UBB9 GAPDH-203ENST00000396858 1292 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TFIP11Q9UBB9 AL589935.1-203ENST00000412751 465 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TFIP11Q9UBB9 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TFIP11Q9UBB9 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TFIP11Q9UBB9 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TFIP11Q9UBB9 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TFIP11Q9UBB9 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TFIP11Q9UBB9 AC107982.2-201ENST00000577360 463 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TFIP11Q9UBB9 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TFIP11Q9UBB9 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TFIP11Q9UBB9 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TFIP11Q9UBB9 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TFIP11Q9UBB9 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TFIP11Q9UBB9 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TFIP11Q9UBB9 COL6A2-204ENST00000409416 3430 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TFIP11Q9UBB9 DACT3-AS1-201ENST00000500689 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TFIP11Q9UBB9 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TFIP11Q9UBB9 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TFIP11Q9UBB9 FOXN4-202ENST00000355216 2958 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms