Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM3

POLR2J2, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-b1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2J2Q9GZM3 DRD3-203ENST00000460779 1557 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
POLR2J2Q9GZM3 AAR2-201ENST00000320849 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
POLR2J2Q9GZM3 ZNF426-204ENST00000593003 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
POLR2J2Q9GZM3 ARMC7-201ENST00000245543 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
POLR2J2Q9GZM3 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
POLR2J2Q9GZM3 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
POLR2J2Q9GZM3 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
POLR2J2Q9GZM3 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
POLR2J2Q9GZM3 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
POLR2J2Q9GZM3 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
POLR2J2Q9GZM3 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
POLR2J2Q9GZM3 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
POLR2J2Q9GZM3 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
POLR2J2Q9GZM3 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
POLR2J2Q9GZM3 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC12.96□□□□□ -0.33
POLR2J2Q9GZM3 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
POLR2J2Q9GZM3 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
POLR2J2Q9GZM3 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
POLR2J2Q9GZM3 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
POLR2J2Q9GZM3 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
POLR2J2Q9GZM3 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
POLR2J2Q9GZM3 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
POLR2J2Q9GZM3 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC12.96□□□□□ -0.33
POLR2J2Q9GZM3 MSH5-202ENST00000375740 2669 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
POLR2J2Q9GZM3 ADGRG6-204ENST00000367609 6887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
POLR2J2Q9GZM3 HSPA6-201ENST00000309758 2371 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
POLR2J2Q9GZM3 NCSTN-201ENST00000294785 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
POLR2J2Q9GZM3 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
POLR2J2Q9GZM3 DAXX-201ENST00000266000 2606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
POLR2J2Q9GZM3 FAM120B-205ENST00000630384 3721 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
POLR2J2Q9GZM3 NLRP2-204ENST00000391721 3420 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
POLR2J2Q9GZM3 RALGAPA1-201ENST00000307138 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
POLR2J2Q9GZM3 ZMYND15-206ENST00000592813 2274 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
POLR2J2Q9GZM3 EIF4G1-207ENST00000411531 4683 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
POLR2J2Q9GZM3 ARAP3-203ENST00000508305 4927 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
POLR2J2Q9GZM3 ADGRD1-201ENST00000261654 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
POLR2J2Q9GZM3 UNC13D-201ENST00000207549 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
POLR2J2Q9GZM3 CLIC4-201ENST00000374379 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
POLR2J2Q9GZM3 INSC-207ENST00000528567 2237 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
POLR2J2Q9GZM3 SLC43A3-214ENST00000529554 2207 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
POLR2J2Q9GZM3 CCT6P3-201ENST00000419314 3702 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
POLR2J2Q9GZM3 AFDN-206ENST00000392112 7459 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
POLR2J2Q9GZM3 NCAPG-201ENST00000251496 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
POLR2J2Q9GZM3 CYP2J2-201ENST00000371204 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
POLR2J2Q9GZM3 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
POLR2J2Q9GZM3 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
POLR2J2Q9GZM3 DSTN-203ENST00000474024 1853 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
POLR2J2Q9GZM3 TRPM5-202ENST00000528453 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
POLR2J2Q9GZM3 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
POLR2J2Q9GZM3 CCDC57-202ENST00000389641 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
POLR2J2Q9GZM3 CCDC57-206ENST00000392347 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
POLR2J2Q9GZM3 DNAJA4-203ENST00000394855 3245 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
POLR2J2Q9GZM3 AMER1-202ENST00000374869 3688 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
POLR2J2Q9GZM3 PEX1-201ENST00000248633 4385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
POLR2J2Q9GZM3 SNCA-204ENST00000394989 3167 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
POLR2J2Q9GZM3 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
POLR2J2Q9GZM3 ARHGAP20-201ENST00000260283 6189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
POLR2J2Q9GZM3 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
POLR2J2Q9GZM3 APOD-201ENST00000343267 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
POLR2J2Q9GZM3 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
POLR2J2Q9GZM3 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
POLR2J2Q9GZM3 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
POLR2J2Q9GZM3 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
POLR2J2Q9GZM3 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
POLR2J2Q9GZM3 AL513211.1-201ENST00000429053 483 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
POLR2J2Q9GZM3 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
POLR2J2Q9GZM3 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
POLR2J2Q9GZM3 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
POLR2J2Q9GZM3 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
POLR2J2Q9GZM3 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
POLR2J2Q9GZM3 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC12.95□□□□□ -0.34
POLR2J2Q9GZM3 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
POLR2J2Q9GZM3 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
POLR2J2Q9GZM3 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
POLR2J2Q9GZM3 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
POLR2J2Q9GZM3 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
POLR2J2Q9GZM3 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
POLR2J2Q9GZM3 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
POLR2J2Q9GZM3 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
POLR2J2Q9GZM3 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
POLR2J2Q9GZM3 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
POLR2J2Q9GZM3 SAP30BP-202ENST00000355423 2439 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
POLR2J2Q9GZM3 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
POLR2J2Q9GZM3 AGAP2-203ENST00000547588 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
POLR2J2Q9GZM3 CES1P1-201ENST00000421606 1704 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
POLR2J2Q9GZM3 AC108024.1-201ENST00000626286 1721 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
POLR2J2Q9GZM3 CACNA1G-208ENST00000442258 7226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
POLR2J2Q9GZM3 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
POLR2J2Q9GZM3 SRPRB-201ENST00000466490 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
POLR2J2Q9GZM3 RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 4625 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
POLR2J2Q9GZM3 RGS12-204ENST00000382788 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
POLR2J2Q9GZM3 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
POLR2J2Q9GZM3 DUOXA1-205ENST00000558422 1678 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
POLR2J2Q9GZM3 SEZ6L-201ENST00000248933 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
POLR2J2Q9GZM3 SEZ6L-210ENST00000629590 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
POLR2J2Q9GZM3 GPRASP1-202ENST00000415986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.95□□□□□ -0.34
POLR2J2Q9GZM3 RPUSD4-201ENST00000298317 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
POLR2J2Q9GZM3 SEC14L5-201ENST00000251170 6459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
POLR2J2Q9GZM3 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
POLR2J2Q9GZM3 ATXN2L-205ENST00000395547 3981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms