Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 SIGLECL1-201ENST00000316401 1708 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 SEPT9-204ENST00000427180 3635 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 NAB1-203ENST00000409641 2472 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 CEP63-215ENST00000606977 2800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 PSG8-AS1-201ENST00000425668 1873 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 HCN3-201ENST00000368358 3718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 NFXL1-202ENST00000381538 3728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 AL162615.1-201ENST00000429893 1653 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC01535-206ENST00000592712 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 MIS12-202ENST00000573759 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC39A11-202ENST00000542342 2752 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 CEP89-201ENST00000305768 5678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 TP53TG5-201ENST00000372726 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 MOG-225ENST00000431798 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 GLUD1P2-203ENST00000631118 486 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 SNCAIP-222ENST00000542191 2729 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 ASTN1-203ENST00000367657 4187 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 DHRS7B-202ENST00000395511 2175 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 GPD1-201ENST00000301149 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 ACOT11-201ENST00000343744 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 SHOX-203ENST00000381578 3757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 PTCHD1-201ENST00000379361 13714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 KCNAB2-201ENST00000164247 4273 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 CARS-201ENST00000278224 2491 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 CICP18-201ENST00000406017 2812 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 RBMY1E-203ENST00000382659 1921 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 RBMY1D-202ENST00000382680 1921 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 RBMY1A1-203ENST00000382707 1921 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 RBMY1B-202ENST00000383020 1921 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 LSINCT5-201ENST00000626215 2647 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 CACNA2D2-206ENST00000479441 3453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 TUB-202ENST00000305253 6420 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 ALKBH1-201ENST00000216489 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 ALOXE3-201ENST00000318227 3053 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 ANP32E-210ENST00000629042 3054 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 ATP6V1B1-201ENST00000234396 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 C17orf53-202ENST00000319977 2725 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 ADPRH-204ENST00000478399 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 PACRG-AS1-201ENST00000626335 2192 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 AC005041.1-201ENST00000517883 7033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 AC008158.1-201ENST00000578759 3668 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 SOCS2-AS1-201ENST00000499137 3325 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 AL357054.4-201ENST00000606285 2814 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 WIPI1-201ENST00000262139 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 TRIM37-203ENST00000393066 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 RCC2P1-201ENST00000452257 1476 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 AIPL1-201ENST00000250087 2783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 STRA6-204ENST00000423167 2776 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF621-201ENST00000310898 2404 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 PRR3-201ENST00000376557 1797 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC5A4-AS1-201ENST00000434942 876 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.1 ms