Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW2

CRACR2A, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRACR2AQ9BSW2 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 CAD-202ENST00000403525 6900 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 CNN2-202ENST00000348419 2033 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 CEACAM20-204ENST00000617951 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 GMIP-201ENST00000203556 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 TRAF3-208ENST00000560371 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 SEC14L5-201ENST00000251170 6459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 SERPINH1-205ENST00000525876 2283 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 DLGAP1-202ENST00000400145 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 ADPRH-205ENST00000478927 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 APOBEC3D-202ENST00000427494 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 BRSK1-206ENST00000590333 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 LINC01662-201ENST00000342888 1859 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 TMEM121B-202ENST00000399875 3961 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 AL590824.1-201ENST00000403828 1349 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 TUBB4AP1-201ENST00000450755 1325 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 MCPH1-AS1-201ENST00000515608 2147 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 KANK2-205ENST00000589359 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 AL772337.1-201ENST00000399186 2014 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 FLNC-202ENST00000346177 9042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 CACNA1C-231ENST00000616390 2833 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 TAB2-208ENST00000636456 3092 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 PTPRH-202ENST00000376350 3877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 ARHGAP20-201ENST00000260283 6189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 AC005865.2-203ENST00000636557 2959 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 HECTD1-203ENST00000553700 9080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 ELN-209ENST00000380576 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 KRT18P8-201ENST00000581937 1246 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 ARFIP1-203ENST00000405727 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 AC040174.1-201ENST00000563003 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 SLC43A3-214ENST00000529554 2207 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 ABCF3-201ENST00000292808 2453 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 AC004623.1-201ENST00000624592 2127 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 ZBTB11-201ENST00000312938 6020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 CCNE2-205ENST00000520509 3330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 PPHLN1-206ENST00000395580 1693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 CCT6P3-201ENST00000419314 3702 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 XRRA1-207ENST00000527087 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 CACNA1G-208ENST00000442258 7226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 PCDHGB7-202ENST00000612073 2785 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 CNP-202ENST00000393892 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 MYOM3-201ENST00000338909 2693 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 ACTR2-202ENST00000377982 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 PLOD2-202ENST00000360060 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 SIGLEC6-201ENST00000343300 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 GTF2IRD2-201ENST00000451013 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 NINL-203ENST00000422516 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 MADD-203ENST00000349238 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 CARS-214ENST00000529772 2637 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 CREBZF-204ENST00000527447 4037 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 ZIK1-201ENST00000307468 2510 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 TP53INP2-202ENST00000374810 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 ASS1-203ENST00000372393 1548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 ADAMTSL2-201ENST00000354484 4068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.3 ms