Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM211-203ENST00000640159 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK5RAP3Q96JB5 AL139424.3-202ENST00000641619 917 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK5RAP3Q96JB5 CPN1-201ENST00000370418 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK5RAP3Q96JB5 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK5RAP3Q96JB5 CANX-202ENST00000452673 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK5RAP3Q96JB5 CFAP43-201ENST00000278064 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK5RAP3Q96JB5 TPM2-204ENST00000378300 1771 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK5RAP3Q96JB5 TLR6-202ENST00000436693 5880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK5RAP3Q96JB5 MARK2P9-201ENST00000430958 1727 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK5RAP3Q96JB5 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK5RAP3Q96JB5 PRAME-205ENST00000405655 2179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK5RAP3Q96JB5 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK5RAP3Q96JB5 FAM224A-201ENST00000419557 2031 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK5RAP3Q96JB5 ITPR2-202ENST00000381340 11405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK5RAP3Q96JB5 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK5RAP3Q96JB5 NIN-206ENST00000453196 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK5RAP3Q96JB5 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK5RAP3Q96JB5 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK5RAP3Q96JB5 GLP2R-204ENST00000574745 1882 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK5RAP3Q96JB5 HEXA-206ENST00000566304 1795 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK5RAP3Q96JB5 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK5RAP3Q96JB5 AC239798.2-201ENST00000415338 3540 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK5RAP3Q96JB5 RB1-201ENST00000267163 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK5RAP3Q96JB5 LMBRD2-201ENST00000296603 8185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK5RAP3Q96JB5 STK25-235ENST00000543554 2556 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK5RAP3Q96JB5 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK5RAP3Q96JB5 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK5RAP3Q96JB5 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK5RAP3Q96JB5 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK5RAP3Q96JB5 AL391647.1-201ENST00000395664 511 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK5RAP3Q96JB5 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK5RAP3Q96JB5 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK5RAP3Q96JB5 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK5RAP3Q96JB5 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK5RAP3Q96JB5 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK5RAP3Q96JB5 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK5RAP3Q96JB5 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK5RAP3Q96JB5 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK5RAP3Q96JB5 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK5RAP3Q96JB5 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK5RAP3Q96JB5 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK5RAP3Q96JB5 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK5RAP3Q96JB5 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK5RAP3Q96JB5 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK5RAP3Q96JB5 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK5RAP3Q96JB5 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK5RAP3Q96JB5 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK5RAP3Q96JB5 LRRC32-201ENST00000260061 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK5RAP3Q96JB5 CPNE5-202ENST00000393189 2542 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK5RAP3Q96JB5 KCNIP1-210ENST00000636734 1613 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK5RAP3Q96JB5 OPLAH-204ENST00000618853 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK5RAP3Q96JB5 ARSD-202ENST00000381154 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK5RAP3Q96JB5 AL117190.1-201ENST00000637474 1985 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK5RAP3Q96JB5 CACNA1G-214ENST00000505165 6633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK5RAP3Q96JB5 CACNA1G-220ENST00000507896 6600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK5RAP3Q96JB5 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK5RAP3Q96JB5 AMER3-202ENST00000423981 6172 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK5RAP3Q96JB5 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK5RAP3Q96JB5 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK5RAP3Q96JB5 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK5RAP3Q96JB5 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK5RAP3Q96JB5 AC005014.1-201ENST00000432006 2976 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK5RAP3Q96JB5 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK5RAP3Q96JB5 CACNA1G-233ENST00000515765 6981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK5RAP3Q96JB5 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK5RAP3Q96JB5 MAP7-202ENST00000432797 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK5RAP3Q96JB5 AC093797.1-201ENST00000411847 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK5RAP3Q96JB5 DFFA-202ENST00000377038 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK5RAP3Q96JB5 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK5RAP3Q96JB5 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK5RAP3Q96JB5 ATG9B-203ENST00000469530 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK5RAP3Q96JB5 RGS9-201ENST00000262406 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK5RAP3Q96JB5 AL731571.1-201ENST00000617058 5428 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK5RAP3Q96JB5 MAP2K3-214ENST00000613338 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK5RAP3Q96JB5 SALL4P6-201ENST00000429385 1691 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK5RAP3Q96JB5 OPN1MW2-201ENST00000369929 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK5RAP3Q96JB5 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK5RAP3Q96JB5 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK5RAP3Q96JB5 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK5RAP3Q96JB5 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK5RAP3Q96JB5 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK5RAP3Q96JB5 AC026310.2-201ENST00000546353 728 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK5RAP3Q96JB5 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK5RAP3Q96JB5 Z98885.2-201ENST00000565177 1567 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDK5RAP3Q96JB5 STX3-207ENST00000633708 3111 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDK5RAP3Q96JB5 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDK5RAP3Q96JB5 NCLN-201ENST00000246117 4005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDK5RAP3Q96JB5 L3MBTL1-204ENST00000418998 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDK5RAP3Q96JB5 SLC52A1-203ENST00000512825 2989 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDK5RAP3Q96JB5 SALL2-205ENST00000611430 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDK5RAP3Q96JB5 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDK5RAP3Q96JB5 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDK5RAP3Q96JB5 TAPBP-234ENST00000434618 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDK5RAP3Q96JB5 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDK5RAP3Q96JB5 PCDHGA5-201ENST00000518069 4602 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDK5RAP3Q96JB5 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDK5RAP3Q96JB5 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDK5RAP3Q96JB5 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDK5RAP3Q96JB5 DGKD-202ENST00000409813 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms