Protein–RNA interactions for Protein: Q8WYN3

CSRNP3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP3Q8WYN3 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CSRNP3Q8WYN3 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CSRNP3Q8WYN3 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CSRNP3Q8WYN3 NRROS-201ENST00000328557 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CSRNP3Q8WYN3 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CSRNP3Q8WYN3 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CSRNP3Q8WYN3 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSRNP3Q8WYN3 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSRNP3Q8WYN3 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSRNP3Q8WYN3 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSRNP3Q8WYN3 LMAN2L-202ENST00000377079 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSRNP3Q8WYN3 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSRNP3Q8WYN3 GDPD5-215ENST00000533805 2424 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSRNP3Q8WYN3 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSRNP3Q8WYN3 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSRNP3Q8WYN3 NAALADL1-201ENST00000340252 2376 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSRNP3Q8WYN3 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSRNP3Q8WYN3 ZNF226-201ENST00000300823 817 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSRNP3Q8WYN3 SIRPB3P-201ENST00000340424 1216 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CSRNP3Q8WYN3 C6orf48-202ENST00000375635 610 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSRNP3Q8WYN3 C6orf48-209ENST00000395789 952 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSRNP3Q8WYN3 RBM4-203ENST00000398692 921 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSRNP3Q8WYN3 SNORD23-201ENST00000408876 110 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CSRNP3Q8WYN3 CTHRC1-202ENST00000415886 571 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSRNP3Q8WYN3 CORO1C-203ENST00000421578 1296 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSRNP3Q8WYN3 NAA60-205ENST00000424546 1149 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSRNP3Q8WYN3 AC093609.1-201ENST00000434020 952 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSRNP3Q8WYN3 PPOX-204ENST00000462866 473 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSRNP3Q8WYN3 CALCA-205ENST00000486207 851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSRNP3Q8WYN3 AC083801.1-201ENST00000491689 358 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CSRNP3Q8WYN3 RBM4-207ENST00000506523 654 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSRNP3Q8WYN3 AP003168.2-201ENST00000531215 471 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSRNP3Q8WYN3 AC145422.1-201ENST00000541574 544 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSRNP3Q8WYN3 SLC25A3-206ENST00000547534 556 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSRNP3Q8WYN3 AC016586.1-201ENST00000600056 684 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSRNP3Q8WYN3 AL451165.2-201ENST00000606971 718 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSRNP3Q8WYN3 ETV2-207ENST00000619399 994 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSRNP3Q8WYN3 ZNRF4-201ENST00000222033 1426 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSRNP3Q8WYN3 STAMBP-204ENST00000409707 1649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSRNP3Q8WYN3 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSRNP3Q8WYN3 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSRNP3Q8WYN3 CASC19-229ENST00000641418 1373 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CSRNP3Q8WYN3 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSRNP3Q8WYN3 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSRNP3Q8WYN3 KRT26-201ENST00000335552 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSRNP3Q8WYN3 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSRNP3Q8WYN3 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSRNP3Q8WYN3 PINX1-201ENST00000314787 1545 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSRNP3Q8WYN3 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSRNP3Q8WYN3 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSRNP3Q8WYN3 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSRNP3Q8WYN3 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSRNP3Q8WYN3 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSRNP3Q8WYN3 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSRNP3Q8WYN3 ABI2-213ENST00000424558 2240 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSRNP3Q8WYN3 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSRNP3Q8WYN3 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSRNP3Q8WYN3 VPS28-201ENST00000292510 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSRNP3Q8WYN3 DHRS7C-201ENST00000330255 1006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSRNP3Q8WYN3 TNNT1-202ENST00000356783 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSRNP3Q8WYN3 VPS28-202ENST00000377348 1097 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSRNP3Q8WYN3 SERF2-204ENST00000402131 586 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSRNP3Q8WYN3 OR7E155P-201ENST00000412208 1014 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CSRNP3Q8WYN3 LINC02026-202ENST00000414309 772 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSRNP3Q8WYN3 AC012506.1-201ENST00000423706 525 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSRNP3Q8WYN3 AC103702.2-203ENST00000425510 379 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSRNP3Q8WYN3 AL929302.1-201ENST00000426556 871 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CSRNP3Q8WYN3 KATNBL1P2-201ENST00000433311 835 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CSRNP3Q8WYN3 NRADDP-201ENST00000437305 691 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CSRNP3Q8WYN3 AC099677.4-201ENST00000446786 380 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSRNP3Q8WYN3 TAGLN3-203ENST00000455401 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSRNP3Q8WYN3 AC026191.1-204ENST00000517846 608 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSRNP3Q8WYN3 VPS28-210ENST00000529182 1010 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSRNP3Q8WYN3 LINC02376-201ENST00000536330 724 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSRNP3Q8WYN3 AL049829.2-201ENST00000554010 285 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSRNP3Q8WYN3 LINC01996-201ENST00000573270 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSRNP3Q8WYN3 ETV4-208ENST00000586826 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSRNP3Q8WYN3 UXT-AS1-202ENST00000591832 565 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSRNP3Q8WYN3 AC006213.5-201ENST00000619673 288 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CSRNP3Q8WYN3 AL590094.1-208ENST00000636917 627 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSRNP3Q8WYN3 ABCD1P2-201ENST00000429313 1601 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CSRNP3Q8WYN3 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSRNP3Q8WYN3 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSRNP3Q8WYN3 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSRNP3Q8WYN3 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSRNP3Q8WYN3 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSRNP3Q8WYN3 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSRNP3Q8WYN3 AC064850.1-201ENST00000413279 1398 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CSRNP3Q8WYN3 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSRNP3Q8WYN3 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSRNP3Q8WYN3 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSRNP3Q8WYN3 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSRNP3Q8WYN3 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CSRNP3Q8WYN3 ZNF493-208ENST00000599461 1769 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CSRNP3Q8WYN3 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSRNP3Q8WYN3 HRH2-202ENST00000377291 2561 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSRNP3Q8WYN3 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSRNP3Q8WYN3 ZNF286A-201ENST00000395893 654 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSRNP3Q8WYN3 PLAC9P1-201ENST00000397540 389 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSRNP3Q8WYN3 AL359853.1-202ENST00000415218 544 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms