Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAP4

LMO3, LIM domain only protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3Q8TAP4 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LMO3Q8TAP4 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LMO3Q8TAP4 LINC01679-201ENST00000442815 2798 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LMO3Q8TAP4 RS1-201ENST00000379984 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LMO3Q8TAP4 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LMO3Q8TAP4 TSN-212ENST00000536142 3328 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LMO3Q8TAP4 CRYM-202ENST00000543948 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LMO3Q8TAP4 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LMO3Q8TAP4 NEU3-204ENST00000531509 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LMO3Q8TAP4 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LMO3Q8TAP4 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LMO3Q8TAP4 PDHB-201ENST00000302746 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LMO3Q8TAP4 GTF2IRD2B-203ENST00000472837 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LMO3Q8TAP4 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LMO3Q8TAP4 TMPRSS4-213ENST00000522824 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LMO3Q8TAP4 PBXIP1-203ENST00000368465 3144 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LMO3Q8TAP4 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LMO3Q8TAP4 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LMO3Q8TAP4 SLC38A5-210ENST00000595796 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LMO3Q8TAP4 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LMO3Q8TAP4 POC5-202ENST00000428202 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LMO3Q8TAP4 RBM4-201ENST00000310092 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LMO3Q8TAP4 LINC00943-204ENST00000537374 1688 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LMO3Q8TAP4 RMND5B-212ENST00000542098 1681 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LMO3Q8TAP4 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LMO3Q8TAP4 MX1-202ENST00000398598 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LMO3Q8TAP4 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LMO3Q8TAP4 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LMO3Q8TAP4 TMEM25-204ENST00000359862 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LMO3Q8TAP4 ZNF721-205ENST00000511833 2966 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LMO3Q8TAP4 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LMO3Q8TAP4 AL359915.2-202ENST00000440150 2469 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LMO3Q8TAP4 KRTAP10-5-201ENST00000400372 1150 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LMO3Q8TAP4 DKKL1P1-201ENST00000400550 698 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
LMO3Q8TAP4 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LMO3Q8TAP4 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LMO3Q8TAP4 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
LMO3Q8TAP4 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
LMO3Q8TAP4 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LMO3Q8TAP4 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
LMO3Q8TAP4 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LMO3Q8TAP4 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LMO3Q8TAP4 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LMO3Q8TAP4 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LMO3Q8TAP4 SNORD3B-1-201ENST00000577988 758 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
LMO3Q8TAP4 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
LMO3Q8TAP4 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LMO3Q8TAP4 LRP8-203ENST00000354412 2553 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LMO3Q8TAP4 UBTF-209ENST00000529383 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LMO3Q8TAP4 DCAF10-202ENST00000377724 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LMO3Q8TAP4 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LMO3Q8TAP4 INTS5-201ENST00000330574 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LMO3Q8TAP4 AC134312.1-201ENST00000378417 3468 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LMO3Q8TAP4 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LMO3Q8TAP4 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LMO3Q8TAP4 AC117503.4-201ENST00000623229 1418 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
LMO3Q8TAP4 ZMYND10-201ENST00000231749 2896 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LMO3Q8TAP4 NCSTN-201ENST00000294785 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LMO3Q8TAP4 LRRFIP1-202ENST00000289175 3709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LMO3Q8TAP4 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LMO3Q8TAP4 CDC42-202ENST00000344548 2256 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LMO3Q8TAP4 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LMO3Q8TAP4 CNBP-205ENST00000500450 1516 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LMO3Q8TAP4 GLRX3-202ENST00000368644 3827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LMO3Q8TAP4 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LMO3Q8TAP4 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LMO3Q8TAP4 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LMO3Q8TAP4 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LMO3Q8TAP4 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LMO3Q8TAP4 DUOXA1-205ENST00000558422 1678 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LMO3Q8TAP4 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LMO3Q8TAP4 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LMO3Q8TAP4 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LMO3Q8TAP4 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LMO3Q8TAP4 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
LMO3Q8TAP4 CSAG1-203ENST00000370291 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LMO3Q8TAP4 AIF1L-205ENST00000372301 671 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LMO3Q8TAP4 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LMO3Q8TAP4 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LMO3Q8TAP4 PRSS3P1-201ENST00000503996 742 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
LMO3Q8TAP4 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
LMO3Q8TAP4 SOCS2-AS1-204ENST00000551626 618 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LMO3Q8TAP4 KRT8P2-201ENST00000556193 944 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
LMO3Q8TAP4 NAA38-204ENST00000575208 529 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LMO3Q8TAP4 AC132812.1-201ENST00000583145 892 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
LMO3Q8TAP4 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
LMO3Q8TAP4 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LMO3Q8TAP4 RCBTB2-205ENST00000544492 2622 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LMO3Q8TAP4 C12orf65-204ENST00000429587 1326 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LMO3Q8TAP4 YY1AP1-208ENST00000361831 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LMO3Q8TAP4 HTR3E-205ENST00000436361 1371 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LMO3Q8TAP4 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LMO3Q8TAP4 FTX-216ENST00000638985 1367 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LMO3Q8TAP4 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LMO3Q8TAP4 LINC01833-203ENST00000437916 2880 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LMO3Q8TAP4 MARK1-201ENST00000366917 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LMO3Q8TAP4 GAPDHS-201ENST00000222286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LMO3Q8TAP4 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LMO3Q8TAP4 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LMO3Q8TAP4 MEFV-203ENST00000536379 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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