Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

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Length 1,256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 AC092131.1-201ENST00000564046 548 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 SIX4-201ENST00000216513 6285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 ZNF341-202ENST00000375200 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 AP3M2-202ENST00000396926 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 CHMP7-201ENST00000313219 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 PPP3R1-201ENST00000234310 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 CSNK1G3-201ENST00000345990 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 GSE1-203ENST00000405402 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 XIRP1-203ENST00000421646 2596 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 CCNC-210ENST00000520429 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 PSD-202ENST00000406432 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 SGMS1-202ENST00000361781 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 SMC6-201ENST00000351948 5173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 GSDMA-201ENST00000301659 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 TEX26-AS1-205ENST00000585870 2053 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 RGS22-201ENST00000360863 4296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 CRY2-202ENST00000443527 4203 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 ICOSLG-202ENST00000400377 2907 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 NINL-203ENST00000422516 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 AFF3-201ENST00000317233 8135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 EXOC3-201ENST00000315013 2682 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 ZC3H18-201ENST00000301011 3729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 POM121L14P-201ENST00000406100 1558 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 SESN3-203ENST00000536441 9558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 DISC1-206ENST00000366637 6848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 UNC5CL-201ENST00000244565 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 TRAF6-202ENST00000526995 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 AP000437.1-201ENST00000624057 2085 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 KIZ-213ENST00000620891 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 APOBEC3D-202ENST00000427494 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 LINC00865-202ENST00000448963 4272 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 C17orf53-203ENST00000585683 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 NISCH-212ENST00000488380 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 CNTNAP1-201ENST00000264638 5276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 MLPH-201ENST00000264605 3823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 PLOD2-202ENST00000360060 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 NXF1-201ENST00000294172 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 AC144450.1-201ENST00000366424 1641 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 HJURP-207ENST00000441687 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 CHIT1-201ENST00000255427 1598 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 AL008727.1-201ENST00000564460 4728 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 UBFD1-207ENST00000567212 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 AC092143.1-201ENST00000556922 2776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 L3MBTL1-204ENST00000418998 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 CD22-209ENST00000594250 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 IGFN1-201ENST00000295591 4439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 AC061965.1-201ENST00000560524 1465 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 CELSR1-201ENST00000262738 11389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 DHX37-201ENST00000308736 4550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 C19orf33-201ENST00000301246 467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 SLC5A4-AS1-201ENST00000434942 876 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 AQP8-202ENST00000566125 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 AC011479.1-202ENST00000591889 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
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