Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 TRIML2-207ENST00000512729 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 LILRB2-202ENST00000391746 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 WFDC2-203ENST00000342873 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 VKORC1-203ENST00000354895 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 SNORA30.1-201ENST00000363193 129 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 NUDT2-203ENST00000379158 1075 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 SNORA50D-201ENST00000408059 134 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 INMT-202ENST00000409539 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 GTF2I-203ENST00000443166 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 RAB6B-205ENST00000486858 880 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 SMIM14-205ENST00000511809 830 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 PIGCP1-201ENST00000527583 895 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 BBOX1-AS1-203ENST00000530430 879 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 BBOX1-AS1-204ENST00000531363 745 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 AC025576.1-201ENST00000536455 462 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 BCL2L2-PABPN1-201ENST00000553781 1241 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 AC004584.1-201ENST00000572187 549 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 AC015818.3-201ENST00000583797 589 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 AL359878.1-201ENST00000381466 1886 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 HSD3B2-206ENST00000543831 1783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 RNF214-201ENST00000300650 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 THEMIS2-201ENST00000328928 2337 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 RNA5SP407-201ENST00000410275 110 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 FHIT-205ENST00000476844 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 AC025265.3-201ENST00000550175 468 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 AC142381.4-201ENST00000566806 702 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 AC142086.5-201ENST00000567619 702 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 AC063977.2-201ENST00000601996 421 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 LINC01535-206ENST00000592712 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 PINX1-201ENST00000314787 1545 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 MCOLN3-201ENST00000341115 1762 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 GTF2A1L-201ENST00000403751 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 ATF3-202ENST00000341491 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 CHRND-206ENST00000543200 2918 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 RPL4P6-201ENST00000438116 1304 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 MRPS28-201ENST00000276585 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 THAP4-203ENST00000402545 833 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 ZNF32-AS2-201ENST00000418966 905 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 RN7SL638P-201ENST00000494527 290 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 AC104117.4-201ENST00000521486 847 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 ACTBP9-201ENST00000587663 1099 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 SDHD-214ENST00000614349 516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 CDH16-204ENST00000565796 2694 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 AL137077.2-201ENST00000635124 1608 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 LINC00511-213ENST00000581549 2265 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 CDK5RAP1-202ENST00000346416 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 TMEM79-202ENST00000357501 975 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 COA6-201ENST00000366612 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 COQ4-202ENST00000372875 928 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 416 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 RAI1-AS1-201ENST00000443696 724 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 AL583722.3-201ENST00000553433 503 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 AC006504.5-210ENST00000585827 539 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 AC022382.1-201ENST00000602768 336 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 AC138430.2-201ENST00000624068 504 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 AL590094.1-206ENST00000635959 478 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 AL590094.1-209ENST00000637260 499 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 ANKDD1A-207ENST00000496660 1477 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
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