Protein–RNA interactions for Protein: Q13670

PMS2P11, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P11Q13670 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 ZNF197-204ENST00000383745 2935 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 DPP8-201ENST00000300141 3139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 MAGI1-217ENST00000611645 6398 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 AC009501.1-201ENST00000429952 2069 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 TUBB4AP1-201ENST00000450755 1325 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 OR2I1P-208ENST00000641137 4948 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 FAM155A-201ENST00000375915 8503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 PPT1-203ENST00000433473 2267 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 LINC00567-201ENST00000569854 3409 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 STOX2-201ENST00000308497 10458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 ZBED8-201ENST00000408953 2851 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 AC011481.3-201ENST00000623895 5594 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 TNFSF8-201ENST00000223795 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 MCPH1-AS1-201ENST00000515608 2147 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 POMT1-203ENST00000372228 3123 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 EBF1-201ENST00000313708 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 TJP2-206ENST00000453658 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 ELP4-203ENST00000395934 1961 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 TNFSF13-203ENST00000380535 2195 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 HSPA6-201ENST00000309758 2371 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 REST-208ENST00000619101 7114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 ZNF799-202ENST00000430385 2583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 ALDH7A1-201ENST00000409134 4964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 RTL10-201ENST00000328554 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 DPP8-204ENST00000358939 2822 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 SPG11-203ENST00000535302 7288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 ARHGEF10L-202ENST00000361221 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 CCNG2-202ENST00000395640 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 KIAA0319-205ENST00000543707 5314 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 DPYSL5-207ENST00000614712 5128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 FRMD1-205ENST00000440994 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 ZFYVE27-205ENST00000370613 2669 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 IKBKE-201ENST00000578328 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 ARFGEF1-201ENST00000262215 7225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 SELPLG-203ENST00000550948 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 SLC4A1-201ENST00000262418 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 FAM156A-208ENST00000615092 2098 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 SLC1A2-208ENST00000606205 1890 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 NFATC2IP-206ENST00000568148 1157 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 GPR173-201ENST00000332582 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 KCNMA1-265ENST00000639591 3888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 VPS13A-204ENST00000376634 10269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 CSNK1E-201ENST00000359867 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 HYOU1-217ENST00000612687 4360 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 FANCA-202ENST00000389301 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 C12orf76-201ENST00000309050 1964 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 ADAM8-201ENST00000415217 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 MARCH3-201ENST00000308660 4196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 HNRNPMP1-201ENST00000560685 1768 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 SCAF8-203ENST00000417268 4944 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 RRBP1-206ENST00000455029 2485 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 FAM90A26-201ENST00000512047 2492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 DRD2-210ENST00000544518 2473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 PCNX4-202ENST00000391611 4073 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 OCA2-202ENST00000354638 3186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 DLL1-201ENST00000366756 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 ACO2-201ENST00000216254 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 SRP54-201ENST00000216774 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 AC090114.2-201ENST00000608477 7054 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 OPRK1-201ENST00000265572 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 FMNL3-205ENST00000550488 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 ADAMTSL1-205ENST00000380548 8030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms