Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
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FOXD4Q12950 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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FOXD4Q12950 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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FOXD4Q12950 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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FOXD4Q12950 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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FOXD4Q12950 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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FOXD4Q12950 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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FOXD4Q12950 MESD-201ENST00000261758 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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FOXD4Q12950 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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FOXD4Q12950 CENPP-203ENST00000375587 8766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
FOXD4Q12950 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 AP3M2-207ENST00000518421 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
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FOXD4Q12950 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
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FOXD4Q12950 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 C16orf82-201ENST00000418886 2268 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
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FOXD4Q12950 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
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FOXD4Q12950 AC016245.1-201ENST00000570335 3204 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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FOXD4Q12950 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 NUTM2E-202ENST00000602967 3623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 RALGPS2-203ENST00000367634 7512 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 SYNM-203ENST00000560674 5908 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 WNT9A-201ENST00000272164 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 AL512306.2-201ENST00000444037 2219 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 CEP170-204ENST00000366544 6805 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 SPG11-201ENST00000261866 7774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 SYK-204ENST00000375754 5005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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