Protein–RNA interactions for Protein: P29374

ARID4A, AT-rich interactive domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID4AP29374 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARID4AP29374 KIF3C-202ENST00000405914 3180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARID4AP29374 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARID4AP29374 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARID4AP29374 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ARID4AP29374 COASY-202ENST00000421097 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARID4AP29374 FAM156A-208ENST00000615092 2098 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARID4AP29374 LINC00969-231ENST00000597482 1476 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARID4AP29374 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARID4AP29374 INO80C-202ENST00000334598 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARID4AP29374 HCG9-201ENST00000376800 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARID4AP29374 WASIR1-201ENST00000399966 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARID4AP29374 EIF4E2-205ENST00000409394 604 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARID4AP29374 TPRKB-203ENST00000409716 816 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARID4AP29374 ELFN1-AS1-201ENST00000415399 636 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARID4AP29374 FAM21EP-201ENST00000417804 985 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ARID4AP29374 BCAS2P2-201ENST00000425064 674 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ARID4AP29374 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARID4AP29374 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ARID4AP29374 SOX2-OT-209ENST00000485035 561 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARID4AP29374 AC008050.1-201ENST00000554926 632 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARID4AP29374 ACSM5-206ENST00000575584 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARID4AP29374 AC005154.1-232ENST00000582549 556 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARID4AP29374 TUBB6-214ENST00000592683 481 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARID4AP29374 SOX2-OT-222ENST00000595084 853 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARID4AP29374 SOX2-OT-232ENST00000600386 792 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARID4AP29374 CSAG3-203ENST00000638835 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARID4AP29374 CSAG2-204ENST00000640702 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARID4AP29374 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARID4AP29374 KANK2-205ENST00000589359 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARID4AP29374 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARID4AP29374 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARID4AP29374 ETNPPL-202ENST00000411864 2028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARID4AP29374 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARID4AP29374 ABCD1P2-201ENST00000429313 1601 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ARID4AP29374 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARID4AP29374 STK3-218ENST00000617590 2485 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARID4AP29374 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARID4AP29374 TMEM78-201ENST00000323223 2175 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARID4AP29374 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARID4AP29374 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARID4AP29374 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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ARID4AP29374 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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ARID4AP29374 DNMT3L-204ENST00000628202 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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ARID4AP29374 ATP5C1-201ENST00000335698 1078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARID4AP29374 PMF1-202ENST00000368277 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARID4AP29374 AL354892.2-201ENST00000413088 403 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
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ARID4AP29374 AC091179.2-201ENST00000495536 532 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
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ARID4AP29374 ZSCAN2-210ENST00000538076 1109 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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ARID4AP29374 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARID4AP29374 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARID4AP29374 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
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ARID4AP29374 ZMIZ1-AS1-203ENST00000456353 2878 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARID4AP29374 GSDMA-201ENST00000301659 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARID4AP29374 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARID4AP29374 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARID4AP29374 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARID4AP29374 KCNIP2-203ENST00000348850 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARID4AP29374 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARID4AP29374 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARID4AP29374 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARID4AP29374 NCLP1-201ENST00000445357 1963 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ARID4AP29374 FAM230C-201ENST00000623511 1970 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARID4AP29374 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARID4AP29374 OR2K2-201ENST00000302681 1078 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARID4AP29374 APOD-201ENST00000343267 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARID4AP29374 IFNLR1-203ENST00000374418 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARID4AP29374 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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