Protein–RNA interactions for Protein: P26951

IL3RA, Interleukin-3 receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL3RAP26951 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
IL3RAP26951 NUP98-204ENST00000397004 3923 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
IL3RAP26951 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
IL3RAP26951 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
IL3RAP26951 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
IL3RAP26951 MIR34AHG-203ENST00000635687 4211 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
IL3RAP26951 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
IL3RAP26951 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
IL3RAP26951 PARD6B-201ENST00000371610 4615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
IL3RAP26951 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
IL3RAP26951 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
IL3RAP26951 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
IL3RAP26951 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
IL3RAP26951 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
IL3RAP26951 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
IL3RAP26951 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
IL3RAP26951 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
IL3RAP26951 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
IL3RAP26951 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC11.65□□□□□ -0.54
IL3RAP26951 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
IL3RAP26951 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
IL3RAP26951 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
IL3RAP26951 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC11.65□□□□□ -0.54
IL3RAP26951 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
IL3RAP26951 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
IL3RAP26951 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
IL3RAP26951 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
IL3RAP26951 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
IL3RAP26951 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
IL3RAP26951 KANK2-205ENST00000589359 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
IL3RAP26951 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
IL3RAP26951 TRIB1-201ENST00000311922 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
IL3RAP26951 EPRS-201ENST00000366923 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
IL3RAP26951 LMCD1-201ENST00000157600 8405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
IL3RAP26951 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
IL3RAP26951 OPLAH-204ENST00000618853 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
IL3RAP26951 GPHN-203ENST00000478722 4297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
IL3RAP26951 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
IL3RAP26951 BAHCC1-201ENST00000307745 10342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
IL3RAP26951 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
IL3RAP26951 MAML3-203ENST00000509479 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
IL3RAP26951 ASAP3-202ENST00000437606 2865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
IL3RAP26951 ZNF106-205ENST00000565611 5081 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
IL3RAP26951 DCAF10-202ENST00000377724 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
IL3RAP26951 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
IL3RAP26951 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
IL3RAP26951 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
IL3RAP26951 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
IL3RAP26951 CDH4-203ENST00000614565 6513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
IL3RAP26951 AC061965.1-201ENST00000560524 1465 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
IL3RAP26951 GULP1-207ENST00000409843 2643 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
IL3RAP26951 FAM219A-207ENST00000379089 3624 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
IL3RAP26951 MKL1-201ENST00000355630 4496 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
IL3RAP26951 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
IL3RAP26951 CUL2-210ENST00000626172 4115 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
IL3RAP26951 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
IL3RAP26951 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
IL3RAP26951 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
IL3RAP26951 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
IL3RAP26951 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
IL3RAP26951 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
IL3RAP26951 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
IL3RAP26951 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
IL3RAP26951 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
IL3RAP26951 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
IL3RAP26951 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
IL3RAP26951 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
IL3RAP26951 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
IL3RAP26951 GOLGA2P8-201ENST00000505201 779 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
IL3RAP26951 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
IL3RAP26951 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
IL3RAP26951 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
IL3RAP26951 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
IL3RAP26951 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
IL3RAP26951 AC005865.2-203ENST00000636557 2959 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
IL3RAP26951 PELP1-201ENST00000301396 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
IL3RAP26951 TLE3-211ENST00000557997 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
IL3RAP26951 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
IL3RAP26951 TRPM2-201ENST00000300481 5627 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
IL3RAP26951 FAHD2A-201ENST00000233379 4757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
IL3RAP26951 NFE2L1-203ENST00000362042 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
IL3RAP26951 KCNMA1-210ENST00000404771 4014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
IL3RAP26951 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
IL3RAP26951 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
IL3RAP26951 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
IL3RAP26951 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
IL3RAP26951 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
IL3RAP26951 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
IL3RAP26951 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
IL3RAP26951 BDNF-208ENST00000418212 4125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
IL3RAP26951 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
IL3RAP26951 C19orf12-209ENST00000623113 4242 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
IL3RAP26951 LIN54-201ENST00000340417 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
IL3RAP26951 DNAJC3-202ENST00000602402 5591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
IL3RAP26951 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
IL3RAP26951 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
IL3RAP26951 GOSR2-235ENST00000640269 2190 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
IL3RAP26951 SDC3-201ENST00000336798 6392 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
IL3RAP26951 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
IL3RAP26951 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms