Protein–RNA interactions for Protein: P26583

HMGB2, High mobility group protein B2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB2P26583 RDH12-203ENST00000551171 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HMGB2P26583 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HMGB2P26583 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HMGB2P26583 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HMGB2P26583 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HMGB2P26583 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HMGB2P26583 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HMGB2P26583 VPREB3-201ENST00000248948 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HMGB2P26583 C19orf33-201ENST00000301246 467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HMGB2P26583 FUNDC1-201ENST00000378045 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HMGB2P26583 PPP1R2P10-201ENST00000393023 595 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HMGB2P26583 VPREB3-202ENST00000398465 503 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HMGB2P26583 POLR2F-202ENST00000405557 560 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HMGB2P26583 AP000959.1-201ENST00000441759 977 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HMGB2P26583 CXXC1P1-202ENST00000489409 1212 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HMGB2P26583 AC099343.1-201ENST00000513481 609 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HMGB2P26583 PIGCP1-201ENST00000527583 895 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HMGB2P26583 LINC02328-202ENST00000554647 522 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HMGB2P26583 AC027682.3-201ENST00000564717 207 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HMGB2P26583 KRT18P8-201ENST00000581937 1246 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HMGB2P26583 AC011479.1-202ENST00000591889 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HMGB2P26583 SMIM17-201ENST00000598409 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HMGB2P26583 AC136475.9-201ENST00000605240 497 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HMGB2P26583 POLR2F-213ENST00000606538 760 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HMGB2P26583 CBR3-AS1-210ENST00000623484 392 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HMGB2P26583 CBR3-AS1-215ENST00000624086 594 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HMGB2P26583 LIMS1-204ENST00000409441 1627 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HMGB2P26583 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HMGB2P26583 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HMGB2P26583 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HMGB2P26583 CACNA2D4-209ENST00000538450 1498 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HMGB2P26583 AC009542.1-201ENST00000412549 1810 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HMGB2P26583 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HMGB2P26583 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HMGB2P26583 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HMGB2P26583 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HMGB2P26583 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HMGB2P26583 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HMGB2P26583 EEF1G-201ENST00000329251 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HMGB2P26583 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HMGB2P26583 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HMGB2P26583 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HMGB2P26583 AL591806.3-201ENST00000289779 2096 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HMGB2P26583 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HMGB2P26583 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HMGB2P26583 PLEKHG6-201ENST00000011684 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HMGB2P26583 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HMGB2P26583 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HMGB2P26583 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HMGB2P26583 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HMGB2P26583 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
HMGB2P26583 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HMGB2P26583 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HMGB2P26583 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HMGB2P26583 AC015691.1-201ENST00000394793 535 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HMGB2P26583 AL590399.1-204ENST00000430302 781 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HMGB2P26583 AC019205.2-201ENST00000442007 1083 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HMGB2P26583 RNF7-205ENST00000480908 782 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HMGB2P26583 AC103724.2-201ENST00000520355 476 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
HMGB2P26583 AP003785.1-201ENST00000544959 492 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HMGB2P26583 GOLGA2P10-201ENST00000550961 817 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
HMGB2P26583 AC127496.3-201ENST00000576032 494 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HMGB2P26583 AC018766.1-201ENST00000601211 484 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HMGB2P26583 AC211476.2-201ENST00000608799 708 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
HMGB2P26583 ZNF674-AS1-202ENST00000609887 672 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HMGB2P26583 RN7SL341P-201ENST00000613745 298 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
HMGB2P26583 GPHB5-202ENST00000621500 543 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HMGB2P26583 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HMGB2P26583 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HMGB2P26583 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HMGB2P26583 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HMGB2P26583 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HMGB2P26583 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HMGB2P26583 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HMGB2P26583 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HMGB2P26583 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HMGB2P26583 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HMGB2P26583 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HMGB2P26583 ZCCHC9-203ENST00000407610 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HMGB2P26583 AP4M1-204ENST00000421755 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HMGB2P26583 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HMGB2P26583 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HMGB2P26583 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
HMGB2P26583 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
HMGB2P26583 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
HMGB2P26583 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HMGB2P26583 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HMGB2P26583 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HMGB2P26583 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
HMGB2P26583 TCP1-215ENST00000544255 1403 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HMGB2P26583 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HMGB2P26583 WASF3-202ENST00000361042 4823 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HMGB2P26583 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HMGB2P26583 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HMGB2P26583 CKMT2-203ENST00000437669 1479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HMGB2P26583 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HMGB2P26583 LYG2-201ENST00000333017 862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HMGB2P26583 ZWINT-202ENST00000361148 807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HMGB2P26583 MT-ND6-201ENST00000361681 525 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HMGB2P26583 LINC00449-201ENST00000366259 872 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms