Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 ENDOV-207ENST00000518907 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOXD8P13378 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOXD8P13378 AP000437.1-201ENST00000624057 2085 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HOXD8P13378 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HOXD8P13378 AC018904.2-201ENST00000561202 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOXD8P13378 GOLGA8N-205ENST00000569659 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HOXD8P13378 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOXD8P13378 GDAP1L1-208ENST00000617075 2645 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HOXD8P13378 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOXD8P13378 C20orf96-202ENST00000382369 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HOXD8P13378 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOXD8P13378 LINC00511-213ENST00000581549 2265 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HOXD8P13378 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOXD8P13378 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOXD8P13378 PSMC5-212ENST00000581882 1474 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HOXD8P13378 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOXD8P13378 OR2V1-204ENST00000641551 2423 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXD8P13378 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXD8P13378 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXD8P13378 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXD8P13378 TGM1-202ENST00000544573 1581 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXD8P13378 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXD8P13378 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXD8P13378 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXD8P13378 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXD8P13378 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXD8P13378 SYBU-217ENST00000528331 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXD8P13378 MGRN1-211ENST00000588994 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXD8P13378 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXD8P13378 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXD8P13378 FSTL4-207ENST00000621681 2660 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXD8P13378 MARK2P9-201ENST00000430958 1727 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HOXD8P13378 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXD8P13378 PGAP2-204ENST00000396991 1798 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXD8P13378 HSD3BP1-201ENST00000286193 1111 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HOXD8P13378 APOD-201ENST00000343267 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXD8P13378 AIG1-203ENST00000367596 559 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXD8P13378 IGLJ1-201ENST00000390320 127 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXD8P13378 CPSF4L-202ENST00000397671 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXD8P13378 KCNE1-202ENST00000399284 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXD8P13378 SNORA50D-201ENST00000408059 134 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HOXD8P13378 AL137244.1-201ENST00000422931 865 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HOXD8P13378 RNLS-203ENST00000437752 525 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXD8P13378 ANAPC15-209ENST00000538919 849 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXD8P13378 BMF-206ENST00000558774 671 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXD8P13378 RN7SL121P-201ENST00000584223 273 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HOXD8P13378 ZNF850-201ENST00000589390 523 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXD8P13378 GMFG-206ENST00000597595 758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXD8P13378 AL162731.1-201ENST00000613248 876 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXD8P13378 TNFRSF10A-204ENST00000613472 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXD8P13378 AC020904.3-201ENST00000624199 442 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HOXD8P13378 MME-218ENST00000625667 363 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXD8P13378 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXD8P13378 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXD8P13378 FAM224A-201ENST00000419557 2031 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXD8P13378 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXD8P13378 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXD8P13378 FAM86C1-202ENST00000359244 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXD8P13378 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXD8P13378 GBAP1-208ENST00000566701 1546 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HOXD8P13378 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXD8P13378 MEG8-221ENST00000636391 2155 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXD8P13378 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXD8P13378 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXD8P13378 NME1-209ENST00000511355 1645 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXD8P13378 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXD8P13378 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXD8P13378 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXD8P13378 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXD8P13378 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HOXD8P13378 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXD8P13378 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXD8P13378 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXD8P13378 AL031587.5-201ENST00000624344 1849 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HOXD8P13378 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXD8P13378 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXD8P13378 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXD8P13378 ATF4-203ENST00000404241 1910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXD8P13378 ZSCAN21-203ENST00000456748 1904 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXD8P13378 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXD8P13378 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXD8P13378 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXD8P13378 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXD8P13378 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXD8P13378 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXD8P13378 PMM1-201ENST00000216259 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXD8P13378 SH3BGRL3-202ENST00000319041 768 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXD8P13378 CRHR1-205ENST00000352855 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXD8P13378 NQO2-204ENST00000380454 851 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXD8P13378 AL357373.1-201ENST00000394974 322 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HOXD8P13378 SAPCD1-AS1-202ENST00000419679 461 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXD8P13378 PLA2G1B-202ENST00000423423 423 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXD8P13378 AC136604.1-202ENST00000425471 771 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HOXD8P13378 AC027612.2-202ENST00000445955 1199 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HOXD8P13378 RN7SL684P-201ENST00000465665 294 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HOXD8P13378 AC138409.2-203ENST00000508395 553 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXD8P13378 TOB1-AS1-202ENST00000514358 690 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXD8P13378 LZTS1-AS1-201ENST00000523103 892 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXD8P13378 AC079949.1-201ENST00000541419 505 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXD8P13378 AC010202.1-201ENST00000551181 405 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms