Protein–RNA interactions for Protein: P11388

TOP2A, DNA topoisomerase 2-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2AP11388 LMAN2L-202ENST00000377079 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TOP2AP11388 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TOP2AP11388 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TOP2AP11388 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TOP2AP11388 CCL24-201ENST00000222902 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TOP2AP11388 GZMH-202ENST00000382548 687 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TOP2AP11388 AC015691.1-201ENST00000394793 535 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TOP2AP11388 Z84721.1-201ENST00000438841 372 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TOP2AP11388 TARM1-202ENST00000616041 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TOP2AP11388 AC112702.1-201ENST00000623712 366 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TOP2AP11388 AC245369.8-201ENST00000636589 306 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TOP2AP11388 ORC5-203ENST00000447452 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TOP2AP11388 LINC00638-201ENST00000555578 2518 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TOP2AP11388 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TOP2AP11388 ADD1-207ENST00000446856 3745 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TOP2AP11388 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TOP2AP11388 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TOP2AP11388 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TOP2AP11388 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TOP2AP11388 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TOP2AP11388 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TOP2AP11388 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TOP2AP11388 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TOP2AP11388 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TOP2AP11388 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TOP2AP11388 SERPINI1-202ENST00000446050 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TOP2AP11388 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TOP2AP11388 RGS6-202ENST00000355512 1564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TOP2AP11388 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TOP2AP11388 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TOP2AP11388 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TOP2AP11388 GSTK1-201ENST00000358406 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TOP2AP11388 NAA10-205ENST00000393712 908 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TOP2AP11388 SERPINB8P1-201ENST00000401898 377 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TOP2AP11388 AL450322.2-201ENST00000421629 759 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TOP2AP11388 AL590399.1-204ENST00000430302 781 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TOP2AP11388 AC015818.3-201ENST00000583797 589 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TOP2AP11388 AL450487.2-201ENST00000615934 407 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TOP2AP11388 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TOP2AP11388 ALG11-204ENST00000616513 1983 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TOP2AP11388 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TOP2AP11388 PGAP2-202ENST00000300730 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TOP2AP11388 PGAP2-203ENST00000396986 1837 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TOP2AP11388 SLC43A3-214ENST00000529554 2207 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TOP2AP11388 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TOP2AP11388 SIGLEC17P-204ENST00000618545 1517 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TOP2AP11388 NAP1L2-201ENST00000373517 2550 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TOP2AP11388 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TOP2AP11388 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TOP2AP11388 TUBA3GP-201ENST00000410028 1325 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TOP2AP11388 BTN2A2-204ENST00000432533 1570 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TOP2AP11388 RBM25-204ENST00000526754 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TOP2AP11388 GGPS1-203ENST00000391855 1407 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TOP2AP11388 KIAA0391-211ENST00000605870 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TOP2AP11388 MT-ND6-201ENST00000361681 525 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TOP2AP11388 PSMA7-202ENST00000370861 773 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TOP2AP11388 VAMP2-203ENST00000481878 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TOP2AP11388 AC107959.3-201ENST00000520840 484 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TOP2AP11388 IFI27L1-209ENST00000555523 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TOP2AP11388 CYP4F10P-201ENST00000589560 752 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TOP2AP11388 SRD5A3-AS1-203ENST00000591915 709 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TOP2AP11388 AC136475.9-201ENST00000605240 497 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TOP2AP11388 PDXDC1-218ENST00000627450 2683 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TOP2AP11388 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TOP2AP11388 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TOP2AP11388 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TOP2AP11388 RCL1-206ENST00000442869 1644 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TOP2AP11388 LINC00682-202ENST00000499082 1384 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TOP2AP11388 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TOP2AP11388 ABI2-213ENST00000424558 2240 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TOP2AP11388 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TOP2AP11388 UBTF-209ENST00000529383 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TOP2AP11388 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TOP2AP11388 XYLB-203ENST00000427323 1666 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TOP2AP11388 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TOP2AP11388 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TOP2AP11388 AL591368.1-201ENST00000437181 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TOP2AP11388 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TOP2AP11388 IP6K2-201ENST00000328631 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TOP2AP11388 DDX19B-208ENST00000563392 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TOP2AP11388 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TOP2AP11388 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TOP2AP11388 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TOP2AP11388 AC009093.9-201ENST00000566038 1611 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TOP2AP11388 U3.41-201ENST00000408711 219 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TOP2AP11388 CYCS-203ENST00000409764 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TOP2AP11388 CLK2P1-201ENST00000416636 1294 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TOP2AP11388 PTPA-219ENST00000435305 530 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TOP2AP11388 IDI2-AS1-204ENST00000437374 896 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TOP2AP11388 RPL13AP5-201ENST00000439189 612 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TOP2AP11388 IMMP1L-215ENST00000534812 612 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TOP2AP11388 AC131009.2-201ENST00000542763 770 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TOP2AP11388 RAB42P1-201ENST00000555078 316 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TOP2AP11388 AC018868.2-201ENST00000559655 1259 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TOP2AP11388 AC008687.7-203ENST00000598442 551 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TOP2AP11388 Metazoa_SRP.68-201ENST00000612673 282 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TOP2AP11388 AL161937.2-201ENST00000615503 403 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TOP2AP11388 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TOP2AP11388 NXPE4-201ENST00000375478 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TOP2AP11388 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms