Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 PEX11B-203ENST00000537888 1632 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GLI3P10071 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GLI3P10071 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GLI3P10071 TNNT2-201ENST00000236918 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GLI3P10071 NDUFB11-201ENST00000276062 948 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GLI3P10071 CAP2-207ENST00000493172 861 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GLI3P10071 MYL6-210ENST00000548400 573 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GLI3P10071 AC011456.1-201ENST00000592270 536 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GLI3P10071 APOBEC3A-205ENST00000618553 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GLI3P10071 UBA3-212ENST00000630585 390 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GLI3P10071 ABCF3-201ENST00000292808 2453 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GLI3P10071 DNAJB8-201ENST00000319153 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GLI3P10071 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GLI3P10071 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GLI3P10071 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GLI3P10071 POM121L14P-201ENST00000406100 1558 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
GLI3P10071 MUC1-225ENST00000612778 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GLI3P10071 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GLI3P10071 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GLI3P10071 GLP2R-204ENST00000574745 1882 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GLI3P10071 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
GLI3P10071 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GLI3P10071 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GLI3P10071 NPNT-211ENST00000506666 2187 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GLI3P10071 C3orf36-201ENST00000408895 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GLI3P10071 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GLI3P10071 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GLI3P10071 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GLI3P10071 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GLI3P10071 SDR16C5-203ENST00000522671 1988 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GLI3P10071 MEG3-214ENST00000519709 1726 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GLI3P10071 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GLI3P10071 AC061965.1-201ENST00000560524 1465 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
GLI3P10071 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GLI3P10071 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GLI3P10071 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GLI3P10071 FXYD2-201ENST00000260287 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GLI3P10071 INO80C-202ENST00000334598 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GLI3P10071 THYN1-202ENST00000352327 835 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GLI3P10071 GSTM1-204ENST00000369823 852 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GLI3P10071 LCN12-202ENST00000371633 579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GLI3P10071 NRSN1-201ENST00000378475 800 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GLI3P10071 AC093627.3-201ENST00000467050 574 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GLI3P10071 DNM1P17-201ENST00000512082 426 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
GLI3P10071 ASS1P9-201ENST00000513426 1236 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
GLI3P10071 OVOL1-AS1-203ENST00000534178 493 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GLI3P10071 AC131009.2-201ENST00000542763 770 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GLI3P10071 PEBP1P1-201ENST00000554856 510 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
GLI3P10071 AC026583.1-201ENST00000561310 569 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GLI3P10071 RN7SL750P-201ENST00000582814 238 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
GLI3P10071 SMIM22-201ENST00000586005 366 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GLI3P10071 AC244102.2-201ENST00000597568 955 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
GLI3P10071 AC010531.7-201ENST00000602665 465 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GLI3P10071 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GLI3P10071 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GLI3P10071 DAXX-201ENST00000266000 2606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GLI3P10071 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GLI3P10071 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GLI3P10071 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GLI3P10071 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GLI3P10071 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GLI3P10071 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GLI3P10071 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GLI3P10071 KLHDC2-211ENST00000557247 1565 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GLI3P10071 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GLI3P10071 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
GLI3P10071 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GLI3P10071 PLPP4-201ENST00000369073 1135 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GLI3P10071 AC244197.2-201ENST00000370438 655 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GLI3P10071 NUDT2-203ENST00000379158 1075 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GLI3P10071 LINC02344-201ENST00000443576 644 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GLI3P10071 AC104623.1-201ENST00000446357 546 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GLI3P10071 LINC01297-202ENST00000453395 624 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GLI3P10071 OARD1-214ENST00000486443 764 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GLI3P10071 BCRP5-201ENST00000514371 253 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
GLI3P10071 MARVELD3-205ENST00000567501 582 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GLI3P10071 SNORD55-201ENST00000581525 80 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
GLI3P10071 ZNF551-202ENST00000596085 469 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GLI3P10071 Metazoa_SRP.168-201ENST00000621608 264 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
GLI3P10071 GH2-205ENST00000622506 702 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GLI3P10071 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GLI3P10071 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GLI3P10071 AP3M2-202ENST00000396926 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GLI3P10071 DDC-212ENST00000615193 1674 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GLI3P10071 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GLI3P10071 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GLI3P10071 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GLI3P10071 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GLI3P10071 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GLI3P10071 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GLI3P10071 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GLI3P10071 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GLI3P10071 ST3GAL3-202ENST00000330208 1479 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GLI3P10071 SH3GLB2-206ENST00000417224 1468 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GLI3P10071 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GLI3P10071 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GLI3P10071 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GLI3P10071 FAM153C-201ENST00000398106 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GLI3P10071 GBAP1-208ENST00000566701 1546 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
GLI3P10071 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.5 ms