Protein–RNA interactions for Protein: P0C7Q3

FAM58BP, Putative cyclin-related protein FAM58B, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM58BPP0C7Q3 APLP2-201ENST00000263574 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
FAM58BPP0C7Q3 CIITA-213ENST00000618327 4657 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM58BPP0C7Q3 PPFIA4-203ENST00000367240 6434 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM58BPP0C7Q3 HNRNPH1-202ENST00000356731 3667 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM58BPP0C7Q3 PCDHA6-201ENST00000378126 3267 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM58BPP0C7Q3 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM58BPP0C7Q3 PRR26-202ENST00000441152 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM58BPP0C7Q3 AL355102.3-201ENST00000554299 1678 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM58BPP0C7Q3 DSCAML1-203ENST00000527706 6099 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM58BPP0C7Q3 ZNF568-206ENST00000455427 2378 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM58BPP0C7Q3 CCT3-204ENST00000368259 1815 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM58BPP0C7Q3 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM58BPP0C7Q3 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM58BPP0C7Q3 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM58BPP0C7Q3 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM58BPP0C7Q3 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM58BPP0C7Q3 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM58BPP0C7Q3 AC016730.1-201ENST00000420828 832 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM58BPP0C7Q3 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM58BPP0C7Q3 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM58BPP0C7Q3 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM58BPP0C7Q3 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM58BPP0C7Q3 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM58BPP0C7Q3 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM58BPP0C7Q3 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM58BPP0C7Q3 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM58BPP0C7Q3 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM58BPP0C7Q3 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM58BPP0C7Q3 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM58BPP0C7Q3 DMTN-220ENST00000523266 2735 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM58BPP0C7Q3 LIX1L-201ENST00000604000 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM58BPP0C7Q3 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM58BPP0C7Q3 TMEM229B-207ENST00000557006 3941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM58BPP0C7Q3 PDE2A-218ENST00000540345 3027 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM58BPP0C7Q3 ATG7-201ENST00000354449 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM58BPP0C7Q3 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM58BPP0C7Q3 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM58BPP0C7Q3 FP325330.2-201ENST00000624219 5630 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM58BPP0C7Q3 MYO15B-236ENST00000633867 6323 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM58BPP0C7Q3 DHX34-201ENST00000328771 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM58BPP0C7Q3 EOGT-202ENST00000383701 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM58BPP0C7Q3 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM58BPP0C7Q3 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM58BPP0C7Q3 MYO16-202ENST00000356711 6874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM58BPP0C7Q3 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM58BPP0C7Q3 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM58BPP0C7Q3 TMEM57-201ENST00000374343 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM58BPP0C7Q3 RPGRIP1-202ENST00000400017 3940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM58BPP0C7Q3 DNAJB13-201ENST00000339764 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM58BPP0C7Q3 RBM47-201ENST00000295971 4056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM58BPP0C7Q3 KIZ-213ENST00000620891 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM58BPP0C7Q3 HERC5-201ENST00000264350 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM58BPP0C7Q3 TBC1D2-204ENST00000375066 3198 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM58BPP0C7Q3 TNRC18P1-201ENST00000502875 3650 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM58BPP0C7Q3 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM58BPP0C7Q3 KCNIP1-208ENST00000520740 1845 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM58BPP0C7Q3 AP2M1-207ENST00000439647 1950 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM58BPP0C7Q3 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM58BPP0C7Q3 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM58BPP0C7Q3 CACNA1G-230ENST00000514717 6699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM58BPP0C7Q3 AC144450.1-201ENST00000366424 1641 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM58BPP0C7Q3 VAMP4-201ENST00000236192 5159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM58BPP0C7Q3 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM58BPP0C7Q3 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM58BPP0C7Q3 NFATC2-207ENST00000610033 2740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM58BPP0C7Q3 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM58BPP0C7Q3 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM58BPP0C7Q3 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM58BPP0C7Q3 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM58BPP0C7Q3 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM58BPP0C7Q3 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM58BPP0C7Q3 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM58BPP0C7Q3 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM58BPP0C7Q3 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM58BPP0C7Q3 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM58BPP0C7Q3 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM58BPP0C7Q3 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM58BPP0C7Q3 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM58BPP0C7Q3 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM58BPP0C7Q3 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM58BPP0C7Q3 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM58BPP0C7Q3 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM58BPP0C7Q3 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM58BPP0C7Q3 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM58BPP0C7Q3 SPACA9-202ENST00000356311 2243 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM58BPP0C7Q3 HRC-201ENST00000252825 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM58BPP0C7Q3 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM58BPP0C7Q3 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM58BPP0C7Q3 AC015819.3-201ENST00000624305 2674 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM58BPP0C7Q3 ARHGAP45-203ENST00000543365 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM58BPP0C7Q3 MYCBP-201ENST00000397572 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM58BPP0C7Q3 SPOCK2-201ENST00000317376 5328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM58BPP0C7Q3 PEX1-201ENST00000248633 4385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM58BPP0C7Q3 LINC00567-201ENST00000569854 3409 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM58BPP0C7Q3 BRAP-202ENST00000419234 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM58BPP0C7Q3 POTEE-201ENST00000356920 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM58BPP0C7Q3 BCL2L1-201ENST00000307677 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM58BPP0C7Q3 PREX1-201ENST00000371941 6636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM58BPP0C7Q3 SEZ6L-201ENST00000248933 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM58BPP0C7Q3 SEZ6L-210ENST00000629590 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms