Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 GCSHP3-201ENST00000431120 391 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 Metazoa_SRP.100-201ENST00000447610 282 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 AC024293.1-201ENST00000467930 498 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 AL713999.1-201ENST00000473363 753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 GOLGA2P8-201ENST00000505201 779 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 ROPN1B-203ENST00000505382 713 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 AC026410.1-201ENST00000507366 1101 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 AC107463.1-201ENST00000508605 667 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 NUDCD2-202ENST00000517501 448 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 CMTM5-208ENST00000555731 831 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 AQP8-202ENST00000566125 1276 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 AC020636.2-201ENST00000569170 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 FAM104A-204ENST00000580032 451 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 TMEM220-AS1-207ENST00000584714 541 ntTSL 4 BASIC11.27□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 AC011444.1-201ENST00000587836 639 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 AC023421.2-201ENST00000589510 313 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 AC010976.2-201ENST00000609697 852 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 AL118522.1-201ENST00000611368 560 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 AL136040.2-201ENST00000618431 1130 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 AC073592.2-201ENST00000623062 780 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 NAA15-202ENST00000398947 6072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 PCDHGA3-201ENST00000253812 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 GOT2-202ENST00000434819 1615 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 FUT8-203ENST00000360689 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 PPP2R5E-201ENST00000337537 6659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 Z84468.1-201ENST00000626321 1408 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 KRT8P43-201ENST00000406052 1458 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 SNRPC-201ENST00000244520 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 SLC50A1-202ENST00000368401 1166 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 TRBV4-1-201ENST00000390357 373 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 TRBV4-2-201ENST00000390392 455 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 OR52M2P-201ENST00000414298 959 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 HMGA1P1-201ENST00000415560 1062 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 RN7SL396P-201ENST00000471086 295 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 AC093909.3-201ENST00000504783 336 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 PGAM1P12-201ENST00000505622 748 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 CHTF8-204ENST00000518041 567 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 ZNF268-210ENST00000541211 781 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 AC026310.2-201ENST00000546353 728 ntTSL 4 BASIC11.26□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 SOCS2-AS1-204ENST00000551626 618 ntTSL 4 BASIC11.26□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 AC115099.1-201ENST00000570413 362 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 INCA1-203ENST00000575780 1221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 RN7SL455P-201ENST00000580629 282 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 ZNF586-204ENST00000598183 603 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 AC005759.1-202ENST00000599416 415 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 HPX-213ENST00000615166 826 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 HELLS-212ENST00000630929 400 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 MTUS1-229ENST00000634613 1193 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 SLC20A2-207ENST00000520179 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 RHOG-201ENST00000351018 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 PDXDC2P-206ENST00000534700 1315 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 CDC45-202ENST00000404724 1693 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 AC006450.3-201ENST00000453529 2146 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 HERPUD1-203ENST00000379792 1782 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 MRPL55-205ENST00000366731 1423 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 CAB39L-204ENST00000409130 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 ZEB2-204ENST00000409487 5361 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
HOXA3O43365 UACA-201ENST00000322954 6939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms