Protein–RNA interactions for Protein: A6NCE7

MAP1LC3B2, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3 beta 2, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3B2A6NCE7 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 ADAMTSL4-AS1-203ENST00000617352 1036 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 LINC01544-201ENST00000567801 5168 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 STAT3-202ENST00000389272 2615 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 PRAME-201ENST00000398741 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 AL356966.1-201ENST00000454752 2367 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 B3GAT2-202ENST00000615536 5206 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 VENTX-201ENST00000325980 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 CXCL5-201ENST00000296027 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 TGFBRAP1-203ENST00000595531 5595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 EFR3B-205ENST00000405108 2432 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 CAST-223ENST00000508608 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 TRIM60-201ENST00000341062 1867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 CHST15-201ENST00000346248 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 MME-204ENST00000462745 3590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 IFFO1-206ENST00000465801 2850 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 ATP11A-202ENST00000375645 8795 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 UAP1L1-201ENST00000360271 3201 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 MED15-201ENST00000263205 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 CSF3R-201ENST00000331941 2375 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 NAPB-201ENST00000377026 3837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 PLB1-201ENST00000327757 5107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 EHMT2-203ENST00000375537 3965 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 SH3KBP1-202ENST00000379698 2678 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 TCAF2-205ENST00000444908 2976 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 ABCA3-201ENST00000301732 6609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 ERI1-209ENST00000523898 5036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 MGRN1-211ENST00000588994 1665 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 MED16-204ENST00000395808 3420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 AAMP-204ENST00000444053 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 GK-203ENST00000378943 3707 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 PPCDC-201ENST00000342932 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 TJAP1-201ENST00000259751 2720 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 COL8A1-202ENST00000273342 3029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 DFFB-205ENST00000378209 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 HOTTIP-203ENST00000521028 3345 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 PDP1-202ENST00000396200 4358 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC11.05□□□□□ -0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 NRXN1-233ENST00000630543 4500 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 SLC8A3-205ENST00000394330 2622 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC11.05□□□□□ -0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 NEK11-209ENST00000510688 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 PRKAB1-206ENST00000541640 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 CPT1C-217ENST00000598293 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 UBA2-201ENST00000246548 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 LRFN5-201ENST00000298119 3723 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 FBLN1-208ENST00000442170 2531 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 PRTFDC1-201ENST00000320152 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 USB1-207ENST00000563149 1751 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 AC008040.5-201ENST00000599781 1781 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 FMO6P-201ENST00000236166 1620 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 GJB1-201ENST00000361726 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 CCDC3-202ENST00000378839 3180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 PIGG-208ENST00000504346 3019 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.5 ms