Protein–RNA interactions for Protein: V9GYV3

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 84 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V9GYV3 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
V9GYV3 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
V9GYV3 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
V9GYV3 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
V9GYV3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
V9GYV3 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
V9GYV3 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
V9GYV3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
V9GYV3 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
V9GYV3 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
V9GYV3 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
V9GYV3 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
V9GYV3 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
V9GYV3 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
V9GYV3 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
V9GYV3 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
V9GYV3 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
V9GYV3 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
V9GYV3 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
V9GYV3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
V9GYV3 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
V9GYV3 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
V9GYV3 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
V9GYV3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
V9GYV3 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
V9GYV3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
V9GYV3 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
V9GYV3 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
V9GYV3 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
V9GYV3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
V9GYV3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
V9GYV3 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
V9GYV3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
V9GYV3 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
V9GYV3 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
V9GYV3 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
V9GYV3 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
V9GYV3 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
V9GYV3 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
V9GYV3 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
V9GYV3 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
V9GYV3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
V9GYV3 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
V9GYV3 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
V9GYV3 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
V9GYV3 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
V9GYV3 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
V9GYV3 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
V9GYV3 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
V9GYV3 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
V9GYV3 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
V9GYV3 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
V9GYV3 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
V9GYV3 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
V9GYV3 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
V9GYV3 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
V9GYV3 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
V9GYV3 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
V9GYV3 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
V9GYV3 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
V9GYV3 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
V9GYV3 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
V9GYV3 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
V9GYV3 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
V9GYV3 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
V9GYV3 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
V9GYV3 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
V9GYV3 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
V9GYV3 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
V9GYV3 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
V9GYV3 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
V9GYV3 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
V9GYV3 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
V9GYV3 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
V9GYV3 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
V9GYV3 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
V9GYV3 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
V9GYV3 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
V9GYV3 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
V9GYV3 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
V9GYV3 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
V9GYV3 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
V9GYV3 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
V9GYV3 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
V9GYV3 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
V9GYV3 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
V9GYV3 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
V9GYV3 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
V9GYV3 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
V9GYV3 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
V9GYV3 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
V9GYV3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
V9GYV3 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
V9GYV3 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
V9GYV3 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
V9GYV3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
V9GYV3 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
V9GYV3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
V9GYV3 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
V9GYV3 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms