Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6J3

SMAD5-AS1, SMAD5 antisense gene protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMAD5-AS1Q9Y6J3 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMAD5-AS1Q9Y6J3 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMAD5-AS1Q9Y6J3 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMAD5-AS1Q9Y6J3 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMAD5-AS1Q9Y6J3 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMAD5-AS1Q9Y6J3 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMAD5-AS1Q9Y6J3 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMAD5-AS1Q9Y6J3 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMAD5-AS1Q9Y6J3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMAD5-AS1Q9Y6J3 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMAD5-AS1Q9Y6J3 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMAD5-AS1Q9Y6J3 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMAD5-AS1Q9Y6J3 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMAD5-AS1Q9Y6J3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMAD5-AS1Q9Y6J3 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMAD5-AS1Q9Y6J3 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMAD5-AS1Q9Y6J3 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMAD5-AS1Q9Y6J3 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMAD5-AS1Q9Y6J3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMAD5-AS1Q9Y6J3 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMAD5-AS1Q9Y6J3 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMAD5-AS1Q9Y6J3 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMAD5-AS1Q9Y6J3 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMAD5-AS1Q9Y6J3 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMAD5-AS1Q9Y6J3 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMAD5-AS1Q9Y6J3 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SMAD5-AS1Q9Y6J3 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMAD5-AS1Q9Y6J3 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMAD5-AS1Q9Y6J3 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMAD5-AS1Q9Y6J3 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms