Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Y9

SCN10A, Sodium channel protein type 10 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN10AQ9Y5Y9 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SCN10AQ9Y5Y9 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SCN10AQ9Y5Y9 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SCN10AQ9Y5Y9 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCN10AQ9Y5Y9 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCN10AQ9Y5Y9 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCN10AQ9Y5Y9 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCN10AQ9Y5Y9 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCN10AQ9Y5Y9 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCN10AQ9Y5Y9 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCN10AQ9Y5Y9 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SCN10AQ9Y5Y9 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCN10AQ9Y5Y9 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCN10AQ9Y5Y9 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCN10AQ9Y5Y9 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCN10AQ9Y5Y9 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCN10AQ9Y5Y9 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCN10AQ9Y5Y9 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCN10AQ9Y5Y9 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCN10AQ9Y5Y9 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCN10AQ9Y5Y9 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCN10AQ9Y5Y9 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCN10AQ9Y5Y9 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCN10AQ9Y5Y9 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCN10AQ9Y5Y9 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCN10AQ9Y5Y9 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCN10AQ9Y5Y9 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCN10AQ9Y5Y9 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCN10AQ9Y5Y9 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SCN10AQ9Y5Y9 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SCN10AQ9Y5Y9 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCN10AQ9Y5Y9 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SCN10AQ9Y5Y9 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SCN10AQ9Y5Y9 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SCN10AQ9Y5Y9 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SCN10AQ9Y5Y9 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SCN10AQ9Y5Y9 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SCN10AQ9Y5Y9 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SCN10AQ9Y5Y9 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SCN10AQ9Y5Y9 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SCN10AQ9Y5Y9 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SCN10AQ9Y5Y9 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SCN10AQ9Y5Y9 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SCN10AQ9Y5Y9 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SCN10AQ9Y5Y9 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCN10AQ9Y5Y9 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCN10AQ9Y5Y9 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCN10AQ9Y5Y9 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCN10AQ9Y5Y9 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SCN10AQ9Y5Y9 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCN10AQ9Y5Y9 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SCN10AQ9Y5Y9 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCN10AQ9Y5Y9 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCN10AQ9Y5Y9 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCN10AQ9Y5Y9 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCN10AQ9Y5Y9 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCN10AQ9Y5Y9 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCN10AQ9Y5Y9 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCN10AQ9Y5Y9 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCN10AQ9Y5Y9 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCN10AQ9Y5Y9 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCN10AQ9Y5Y9 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCN10AQ9Y5Y9 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCN10AQ9Y5Y9 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCN10AQ9Y5Y9 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCN10AQ9Y5Y9 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCN10AQ9Y5Y9 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCN10AQ9Y5Y9 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCN10AQ9Y5Y9 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCN10AQ9Y5Y9 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCN10AQ9Y5Y9 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCN10AQ9Y5Y9 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCN10AQ9Y5Y9 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCN10AQ9Y5Y9 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCN10AQ9Y5Y9 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCN10AQ9Y5Y9 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCN10AQ9Y5Y9 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCN10AQ9Y5Y9 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCN10AQ9Y5Y9 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCN10AQ9Y5Y9 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCN10AQ9Y5Y9 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCN10AQ9Y5Y9 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCN10AQ9Y5Y9 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCN10AQ9Y5Y9 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCN10AQ9Y5Y9 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCN10AQ9Y5Y9 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCN10AQ9Y5Y9 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCN10AQ9Y5Y9 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCN10AQ9Y5Y9 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCN10AQ9Y5Y9 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCN10AQ9Y5Y9 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCN10AQ9Y5Y9 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCN10AQ9Y5Y9 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCN10AQ9Y5Y9 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCN10AQ9Y5Y9 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCN10AQ9Y5Y9 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCN10AQ9Y5Y9 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCN10AQ9Y5Y9 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCN10AQ9Y5Y9 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCN10AQ9Y5Y9 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms