Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X0

SNX10, Sorting nexin-10, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX10Q9Y5X0 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNX10Q9Y5X0 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SNX10Q9Y5X0 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNX10Q9Y5X0 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNX10Q9Y5X0 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNX10Q9Y5X0 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNX10Q9Y5X0 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNX10Q9Y5X0 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNX10Q9Y5X0 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNX10Q9Y5X0 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNX10Q9Y5X0 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNX10Q9Y5X0 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNX10Q9Y5X0 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNX10Q9Y5X0 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNX10Q9Y5X0 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNX10Q9Y5X0 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNX10Q9Y5X0 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNX10Q9Y5X0 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNX10Q9Y5X0 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNX10Q9Y5X0 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNX10Q9Y5X0 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNX10Q9Y5X0 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNX10Q9Y5X0 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNX10Q9Y5X0 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNX10Q9Y5X0 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNX10Q9Y5X0 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SNX10Q9Y5X0 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNX10Q9Y5X0 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNX10Q9Y5X0 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNX10Q9Y5X0 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNX10Q9Y5X0 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNX10Q9Y5X0 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNX10Q9Y5X0 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNX10Q9Y5X0 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNX10Q9Y5X0 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNX10Q9Y5X0 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNX10Q9Y5X0 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNX10Q9Y5X0 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNX10Q9Y5X0 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNX10Q9Y5X0 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNX10Q9Y5X0 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNX10Q9Y5X0 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNX10Q9Y5X0 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNX10Q9Y5X0 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNX10Q9Y5X0 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNX10Q9Y5X0 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNX10Q9Y5X0 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNX10Q9Y5X0 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNX10Q9Y5X0 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNX10Q9Y5X0 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNX10Q9Y5X0 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNX10Q9Y5X0 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNX10Q9Y5X0 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNX10Q9Y5X0 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNX10Q9Y5X0 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNX10Q9Y5X0 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNX10Q9Y5X0 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNX10Q9Y5X0 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SNX10Q9Y5X0 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNX10Q9Y5X0 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNX10Q9Y5X0 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNX10Q9Y5X0 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNX10Q9Y5X0 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
SNX10Q9Y5X0 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SNX10Q9Y5X0 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SNX10Q9Y5X0 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNX10Q9Y5X0 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNX10Q9Y5X0 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNX10Q9Y5X0 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNX10Q9Y5X0 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNX10Q9Y5X0 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX10Q9Y5X0 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX10Q9Y5X0 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX10Q9Y5X0 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX10Q9Y5X0 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX10Q9Y5X0 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX10Q9Y5X0 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX10Q9Y5X0 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX10Q9Y5X0 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX10Q9Y5X0 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX10Q9Y5X0 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX10Q9Y5X0 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX10Q9Y5X0 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX10Q9Y5X0 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX10Q9Y5X0 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX10Q9Y5X0 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNX10Q9Y5X0 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNX10Q9Y5X0 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNX10Q9Y5X0 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNX10Q9Y5X0 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNX10Q9Y5X0 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNX10Q9Y5X0 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNX10Q9Y5X0 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SNX10Q9Y5X0 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNX10Q9Y5X0 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNX10Q9Y5X0 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNX10Q9Y5X0 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNX10Q9Y5X0 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNX10Q9Y5X0 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNX10Q9Y5X0 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 174.6 ms