Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5M8

SRPRB, Signal recognition particle receptor subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRBQ9Y5M8 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SRPRBQ9Y5M8 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SRPRBQ9Y5M8 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SRPRBQ9Y5M8 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SRPRBQ9Y5M8 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SRPRBQ9Y5M8 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SRPRBQ9Y5M8 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SRPRBQ9Y5M8 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SRPRBQ9Y5M8 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SRPRBQ9Y5M8 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SRPRBQ9Y5M8 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SRPRBQ9Y5M8 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SRPRBQ9Y5M8 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SRPRBQ9Y5M8 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SRPRBQ9Y5M8 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SRPRBQ9Y5M8 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SRPRBQ9Y5M8 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SRPRBQ9Y5M8 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SRPRBQ9Y5M8 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SRPRBQ9Y5M8 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SRPRBQ9Y5M8 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SRPRBQ9Y5M8 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SRPRBQ9Y5M8 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SRPRBQ9Y5M8 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SRPRBQ9Y5M8 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SRPRBQ9Y5M8 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SRPRBQ9Y5M8 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SRPRBQ9Y5M8 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SRPRBQ9Y5M8 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SRPRBQ9Y5M8 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SRPRBQ9Y5M8 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SRPRBQ9Y5M8 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SRPRBQ9Y5M8 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SRPRBQ9Y5M8 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SRPRBQ9Y5M8 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SRPRBQ9Y5M8 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SRPRBQ9Y5M8 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SRPRBQ9Y5M8 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SRPRBQ9Y5M8 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SRPRBQ9Y5M8 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SRPRBQ9Y5M8 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SRPRBQ9Y5M8 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SRPRBQ9Y5M8 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SRPRBQ9Y5M8 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SRPRBQ9Y5M8 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SRPRBQ9Y5M8 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SRPRBQ9Y5M8 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SRPRBQ9Y5M8 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SRPRBQ9Y5M8 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SRPRBQ9Y5M8 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SRPRBQ9Y5M8 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SRPRBQ9Y5M8 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SRPRBQ9Y5M8 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SRPRBQ9Y5M8 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SRPRBQ9Y5M8 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SRPRBQ9Y5M8 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SRPRBQ9Y5M8 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SRPRBQ9Y5M8 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SRPRBQ9Y5M8 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SRPRBQ9Y5M8 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SRPRBQ9Y5M8 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SRPRBQ9Y5M8 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SRPRBQ9Y5M8 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SRPRBQ9Y5M8 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SRPRBQ9Y5M8 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SRPRBQ9Y5M8 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SRPRBQ9Y5M8 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SRPRBQ9Y5M8 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SRPRBQ9Y5M8 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SRPRBQ9Y5M8 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SRPRBQ9Y5M8 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SRPRBQ9Y5M8 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SRPRBQ9Y5M8 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SRPRBQ9Y5M8 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SRPRBQ9Y5M8 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SRPRBQ9Y5M8 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SRPRBQ9Y5M8 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SRPRBQ9Y5M8 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SRPRBQ9Y5M8 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SRPRBQ9Y5M8 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SRPRBQ9Y5M8 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SRPRBQ9Y5M8 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SRPRBQ9Y5M8 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SRPRBQ9Y5M8 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SRPRBQ9Y5M8 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SRPRBQ9Y5M8 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SRPRBQ9Y5M8 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SRPRBQ9Y5M8 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SRPRBQ9Y5M8 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SRPRBQ9Y5M8 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SRPRBQ9Y5M8 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SRPRBQ9Y5M8 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SRPRBQ9Y5M8 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SRPRBQ9Y5M8 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SRPRBQ9Y5M8 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SRPRBQ9Y5M8 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SRPRBQ9Y5M8 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SRPRBQ9Y5M8 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SRPRBQ9Y5M8 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SRPRBQ9Y5M8 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms