Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SH3BP1Q9Y3L3 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SH3BP1Q9Y3L3 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SH3BP1Q9Y3L3 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SH3BP1Q9Y3L3 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SH3BP1Q9Y3L3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SH3BP1Q9Y3L3 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SH3BP1Q9Y3L3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SH3BP1Q9Y3L3 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SH3BP1Q9Y3L3 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SH3BP1Q9Y3L3 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SH3BP1Q9Y3L3 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SH3BP1Q9Y3L3 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SH3BP1Q9Y3L3 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SH3BP1Q9Y3L3 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SH3BP1Q9Y3L3 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SH3BP1Q9Y3L3 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SH3BP1Q9Y3L3 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SH3BP1Q9Y3L3 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SH3BP1Q9Y3L3 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SH3BP1Q9Y3L3 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SH3BP1Q9Y3L3 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SH3BP1Q9Y3L3 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SH3BP1Q9Y3L3 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SH3BP1Q9Y3L3 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SH3BP1Q9Y3L3 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SH3BP1Q9Y3L3 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SH3BP1Q9Y3L3 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SH3BP1Q9Y3L3 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SH3BP1Q9Y3L3 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SH3BP1Q9Y3L3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SH3BP1Q9Y3L3 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SH3BP1Q9Y3L3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SH3BP1Q9Y3L3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SH3BP1Q9Y3L3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SH3BP1Q9Y3L3 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SH3BP1Q9Y3L3 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SH3BP1Q9Y3L3 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SH3BP1Q9Y3L3 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SH3BP1Q9Y3L3 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SH3BP1Q9Y3L3 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SH3BP1Q9Y3L3 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SH3BP1Q9Y3L3 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SH3BP1Q9Y3L3 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SH3BP1Q9Y3L3 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SH3BP1Q9Y3L3 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SH3BP1Q9Y3L3 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SH3BP1Q9Y3L3 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SH3BP1Q9Y3L3 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SH3BP1Q9Y3L3 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SH3BP1Q9Y3L3 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SH3BP1Q9Y3L3 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SH3BP1Q9Y3L3 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SH3BP1Q9Y3L3 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SH3BP1Q9Y3L3 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SH3BP1Q9Y3L3 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SH3BP1Q9Y3L3 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SH3BP1Q9Y3L3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SH3BP1Q9Y3L3 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SH3BP1Q9Y3L3 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SH3BP1Q9Y3L3 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SH3BP1Q9Y3L3 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SH3BP1Q9Y3L3 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SH3BP1Q9Y3L3 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SH3BP1Q9Y3L3 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SH3BP1Q9Y3L3 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SH3BP1Q9Y3L3 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SH3BP1Q9Y3L3 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SH3BP1Q9Y3L3 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SH3BP1Q9Y3L3 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SH3BP1Q9Y3L3 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SH3BP1Q9Y3L3 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SH3BP1Q9Y3L3 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SH3BP1Q9Y3L3 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SH3BP1Q9Y3L3 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SH3BP1Q9Y3L3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SH3BP1Q9Y3L3 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SH3BP1Q9Y3L3 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SH3BP1Q9Y3L3 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SH3BP1Q9Y3L3 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SH3BP1Q9Y3L3 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SH3BP1Q9Y3L3 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SH3BP1Q9Y3L3 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SH3BP1Q9Y3L3 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SH3BP1Q9Y3L3 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SH3BP1Q9Y3L3 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SH3BP1Q9Y3L3 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SH3BP1Q9Y3L3 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SH3BP1Q9Y3L3 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SH3BP1Q9Y3L3 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SH3BP1Q9Y3L3 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SH3BP1Q9Y3L3 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SH3BP1Q9Y3L3 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SH3BP1Q9Y3L3 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.2 ms