Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HDGFL3Q9Y3E1 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HDGFL3Q9Y3E1 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HDGFL3Q9Y3E1 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HDGFL3Q9Y3E1 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HDGFL3Q9Y3E1 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HDGFL3Q9Y3E1 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
HDGFL3Q9Y3E1 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HDGFL3Q9Y3E1 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HDGFL3Q9Y3E1 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HDGFL3Q9Y3E1 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HDGFL3Q9Y3E1 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HDGFL3Q9Y3E1 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HDGFL3Q9Y3E1 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HDGFL3Q9Y3E1 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
HDGFL3Q9Y3E1 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HDGFL3Q9Y3E1 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HDGFL3Q9Y3E1 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HDGFL3Q9Y3E1 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HDGFL3Q9Y3E1 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HDGFL3Q9Y3E1 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HDGFL3Q9Y3E1 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HDGFL3Q9Y3E1 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HDGFL3Q9Y3E1 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HDGFL3Q9Y3E1 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HDGFL3Q9Y3E1 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HDGFL3Q9Y3E1 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HDGFL3Q9Y3E1 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HDGFL3Q9Y3E1 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HDGFL3Q9Y3E1 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HDGFL3Q9Y3E1 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HDGFL3Q9Y3E1 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HDGFL3Q9Y3E1 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HDGFL3Q9Y3E1 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HDGFL3Q9Y3E1 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
HDGFL3Q9Y3E1 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
HDGFL3Q9Y3E1 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
HDGFL3Q9Y3E1 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HDGFL3Q9Y3E1 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HDGFL3Q9Y3E1 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HDGFL3Q9Y3E1 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HDGFL3Q9Y3E1 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HDGFL3Q9Y3E1 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HDGFL3Q9Y3E1 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HDGFL3Q9Y3E1 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HDGFL3Q9Y3E1 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
HDGFL3Q9Y3E1 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HDGFL3Q9Y3E1 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HDGFL3Q9Y3E1 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
HDGFL3Q9Y3E1 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HDGFL3Q9Y3E1 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HDGFL3Q9Y3E1 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HDGFL3Q9Y3E1 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HDGFL3Q9Y3E1 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HDGFL3Q9Y3E1 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HDGFL3Q9Y3E1 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
HDGFL3Q9Y3E1 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HDGFL3Q9Y3E1 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HDGFL3Q9Y3E1 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
HDGFL3Q9Y3E1 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HDGFL3Q9Y3E1 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HDGFL3Q9Y3E1 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HDGFL3Q9Y3E1 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
HDGFL3Q9Y3E1 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HDGFL3Q9Y3E1 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HDGFL3Q9Y3E1 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HDGFL3Q9Y3E1 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HDGFL3Q9Y3E1 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HDGFL3Q9Y3E1 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
HDGFL3Q9Y3E1 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HDGFL3Q9Y3E1 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HDGFL3Q9Y3E1 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HDGFL3Q9Y3E1 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HDGFL3Q9Y3E1 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HDGFL3Q9Y3E1 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HDGFL3Q9Y3E1 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HDGFL3Q9Y3E1 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HDGFL3Q9Y3E1 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HDGFL3Q9Y3E1 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HDGFL3Q9Y3E1 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HDGFL3Q9Y3E1 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HDGFL3Q9Y3E1 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HDGFL3Q9Y3E1 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HDGFL3Q9Y3E1 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HDGFL3Q9Y3E1 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HDGFL3Q9Y3E1 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
HDGFL3Q9Y3E1 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
HDGFL3Q9Y3E1 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
HDGFL3Q9Y3E1 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
HDGFL3Q9Y3E1 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HDGFL3Q9Y3E1 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
HDGFL3Q9Y3E1 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HDGFL3Q9Y3E1 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HDGFL3Q9Y3E1 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HDGFL3Q9Y3E1 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HDGFL3Q9Y3E1 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HDGFL3Q9Y3E1 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms