Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TRIM35Q9UPQ4 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
TRIM35Q9UPQ4 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TRIM35Q9UPQ4 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TRIM35Q9UPQ4 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TRIM35Q9UPQ4 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TRIM35Q9UPQ4 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TRIM35Q9UPQ4 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TRIM35Q9UPQ4 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TRIM35Q9UPQ4 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TRIM35Q9UPQ4 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
TRIM35Q9UPQ4 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TRIM35Q9UPQ4 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TRIM35Q9UPQ4 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TRIM35Q9UPQ4 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TRIM35Q9UPQ4 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TRIM35Q9UPQ4 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
TRIM35Q9UPQ4 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TRIM35Q9UPQ4 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TRIM35Q9UPQ4 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TRIM35Q9UPQ4 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TRIM35Q9UPQ4 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TRIM35Q9UPQ4 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TRIM35Q9UPQ4 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TRIM35Q9UPQ4 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TRIM35Q9UPQ4 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TRIM35Q9UPQ4 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TRIM35Q9UPQ4 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TRIM35Q9UPQ4 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
TRIM35Q9UPQ4 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TRIM35Q9UPQ4 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TRIM35Q9UPQ4 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TRIM35Q9UPQ4 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TRIM35Q9UPQ4 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
TRIM35Q9UPQ4 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TRIM35Q9UPQ4 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TRIM35Q9UPQ4 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
TRIM35Q9UPQ4 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TRIM35Q9UPQ4 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TRIM35Q9UPQ4 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TRIM35Q9UPQ4 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
TRIM35Q9UPQ4 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
TRIM35Q9UPQ4 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TRIM35Q9UPQ4 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
TRIM35Q9UPQ4 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
TRIM35Q9UPQ4 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TRIM35Q9UPQ4 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TRIM35Q9UPQ4 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TRIM35Q9UPQ4 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TRIM35Q9UPQ4 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TRIM35Q9UPQ4 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TRIM35Q9UPQ4 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TRIM35Q9UPQ4 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TRIM35Q9UPQ4 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TRIM35Q9UPQ4 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
TRIM35Q9UPQ4 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TRIM35Q9UPQ4 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
TRIM35Q9UPQ4 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TRIM35Q9UPQ4 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TRIM35Q9UPQ4 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TRIM35Q9UPQ4 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TRIM35Q9UPQ4 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TRIM35Q9UPQ4 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TRIM35Q9UPQ4 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TRIM35Q9UPQ4 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TRIM35Q9UPQ4 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TRIM35Q9UPQ4 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TRIM35Q9UPQ4 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TRIM35Q9UPQ4 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
TRIM35Q9UPQ4 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TRIM35Q9UPQ4 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TRIM35Q9UPQ4 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TRIM35Q9UPQ4 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TRIM35Q9UPQ4 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TRIM35Q9UPQ4 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TRIM35Q9UPQ4 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TRIM35Q9UPQ4 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TRIM35Q9UPQ4 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TRIM35Q9UPQ4 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TRIM35Q9UPQ4 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
TRIM35Q9UPQ4 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
TRIM35Q9UPQ4 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
TRIM35Q9UPQ4 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TRIM35Q9UPQ4 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TRIM35Q9UPQ4 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TRIM35Q9UPQ4 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
TRIM35Q9UPQ4 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
TRIM35Q9UPQ4 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
TRIM35Q9UPQ4 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
TRIM35Q9UPQ4 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
TRIM35Q9UPQ4 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
TRIM35Q9UPQ4 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
TRIM35Q9UPQ4 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
TRIM35Q9UPQ4 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
TRIM35Q9UPQ4 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
TRIM35Q9UPQ4 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TRIM35Q9UPQ4 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
TRIM35Q9UPQ4 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TRIM35Q9UPQ4 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
TRIM35Q9UPQ4 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms