Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPN6

SCAF8, Protein SCAF8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF8Q9UPN6 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
SCAF8Q9UPN6 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SCAF8Q9UPN6 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SCAF8Q9UPN6 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SCAF8Q9UPN6 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SCAF8Q9UPN6 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SCAF8Q9UPN6 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SCAF8Q9UPN6 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SCAF8Q9UPN6 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SCAF8Q9UPN6 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
SCAF8Q9UPN6 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SCAF8Q9UPN6 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SCAF8Q9UPN6 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SCAF8Q9UPN6 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SCAF8Q9UPN6 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SCAF8Q9UPN6 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SCAF8Q9UPN6 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SCAF8Q9UPN6 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SCAF8Q9UPN6 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SCAF8Q9UPN6 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SCAF8Q9UPN6 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SCAF8Q9UPN6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SCAF8Q9UPN6 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SCAF8Q9UPN6 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SCAF8Q9UPN6 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SCAF8Q9UPN6 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SCAF8Q9UPN6 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SCAF8Q9UPN6 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SCAF8Q9UPN6 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SCAF8Q9UPN6 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SCAF8Q9UPN6 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SCAF8Q9UPN6 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SCAF8Q9UPN6 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SCAF8Q9UPN6 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SCAF8Q9UPN6 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SCAF8Q9UPN6 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SCAF8Q9UPN6 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SCAF8Q9UPN6 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SCAF8Q9UPN6 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SCAF8Q9UPN6 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SCAF8Q9UPN6 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SCAF8Q9UPN6 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SCAF8Q9UPN6 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SCAF8Q9UPN6 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SCAF8Q9UPN6 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SCAF8Q9UPN6 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SCAF8Q9UPN6 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
SCAF8Q9UPN6 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SCAF8Q9UPN6 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SCAF8Q9UPN6 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
SCAF8Q9UPN6 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
SCAF8Q9UPN6 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
SCAF8Q9UPN6 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SCAF8Q9UPN6 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SCAF8Q9UPN6 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SCAF8Q9UPN6 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
SCAF8Q9UPN6 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SCAF8Q9UPN6 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SCAF8Q9UPN6 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SCAF8Q9UPN6 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SCAF8Q9UPN6 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SCAF8Q9UPN6 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SCAF8Q9UPN6 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SCAF8Q9UPN6 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SCAF8Q9UPN6 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SCAF8Q9UPN6 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SCAF8Q9UPN6 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SCAF8Q9UPN6 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SCAF8Q9UPN6 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SCAF8Q9UPN6 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SCAF8Q9UPN6 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SCAF8Q9UPN6 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SCAF8Q9UPN6 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SCAF8Q9UPN6 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SCAF8Q9UPN6 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SCAF8Q9UPN6 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SCAF8Q9UPN6 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SCAF8Q9UPN6 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SCAF8Q9UPN6 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SCAF8Q9UPN6 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SCAF8Q9UPN6 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SCAF8Q9UPN6 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SCAF8Q9UPN6 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SCAF8Q9UPN6 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SCAF8Q9UPN6 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SCAF8Q9UPN6 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SCAF8Q9UPN6 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SCAF8Q9UPN6 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SCAF8Q9UPN6 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SCAF8Q9UPN6 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
SCAF8Q9UPN6 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SCAF8Q9UPN6 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SCAF8Q9UPN6 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SCAF8Q9UPN6 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SCAF8Q9UPN6 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SCAF8Q9UPN6 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SCAF8Q9UPN6 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SCAF8Q9UPN6 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SCAF8Q9UPN6 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SCAF8Q9UPN6 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms