Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMQ3

BARX2, Homeobox protein BarH-like 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BARX2Q9UMQ3 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BARX2Q9UMQ3 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BARX2Q9UMQ3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BARX2Q9UMQ3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BARX2Q9UMQ3 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BARX2Q9UMQ3 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BARX2Q9UMQ3 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BARX2Q9UMQ3 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BARX2Q9UMQ3 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
BARX2Q9UMQ3 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BARX2Q9UMQ3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BARX2Q9UMQ3 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BARX2Q9UMQ3 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BARX2Q9UMQ3 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BARX2Q9UMQ3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BARX2Q9UMQ3 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BARX2Q9UMQ3 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BARX2Q9UMQ3 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BARX2Q9UMQ3 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BARX2Q9UMQ3 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BARX2Q9UMQ3 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BARX2Q9UMQ3 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
BARX2Q9UMQ3 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BARX2Q9UMQ3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BARX2Q9UMQ3 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BARX2Q9UMQ3 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BARX2Q9UMQ3 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BARX2Q9UMQ3 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BARX2Q9UMQ3 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BARX2Q9UMQ3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BARX2Q9UMQ3 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BARX2Q9UMQ3 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BARX2Q9UMQ3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BARX2Q9UMQ3 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BARX2Q9UMQ3 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BARX2Q9UMQ3 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BARX2Q9UMQ3 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BARX2Q9UMQ3 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BARX2Q9UMQ3 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BARX2Q9UMQ3 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BARX2Q9UMQ3 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BARX2Q9UMQ3 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
BARX2Q9UMQ3 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BARX2Q9UMQ3 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BARX2Q9UMQ3 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BARX2Q9UMQ3 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BARX2Q9UMQ3 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BARX2Q9UMQ3 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BARX2Q9UMQ3 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BARX2Q9UMQ3 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BARX2Q9UMQ3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BARX2Q9UMQ3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BARX2Q9UMQ3 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BARX2Q9UMQ3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BARX2Q9UMQ3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BARX2Q9UMQ3 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BARX2Q9UMQ3 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BARX2Q9UMQ3 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BARX2Q9UMQ3 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BARX2Q9UMQ3 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BARX2Q9UMQ3 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BARX2Q9UMQ3 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BARX2Q9UMQ3 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BARX2Q9UMQ3 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BARX2Q9UMQ3 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BARX2Q9UMQ3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BARX2Q9UMQ3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BARX2Q9UMQ3 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BARX2Q9UMQ3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BARX2Q9UMQ3 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BARX2Q9UMQ3 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BARX2Q9UMQ3 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BARX2Q9UMQ3 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BARX2Q9UMQ3 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BARX2Q9UMQ3 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BARX2Q9UMQ3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BARX2Q9UMQ3 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BARX2Q9UMQ3 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BARX2Q9UMQ3 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BARX2Q9UMQ3 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
BARX2Q9UMQ3 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BARX2Q9UMQ3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BARX2Q9UMQ3 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BARX2Q9UMQ3 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BARX2Q9UMQ3 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BARX2Q9UMQ3 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BARX2Q9UMQ3 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BARX2Q9UMQ3 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
BARX2Q9UMQ3 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BARX2Q9UMQ3 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BARX2Q9UMQ3 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BARX2Q9UMQ3 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BARX2Q9UMQ3 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BARX2Q9UMQ3 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
BARX2Q9UMQ3 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
BARX2Q9UMQ3 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BARX2Q9UMQ3 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BARX2Q9UMQ3 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BARX2Q9UMQ3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BARX2Q9UMQ3 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms