Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL51

HCN2, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 2, humanhuman

Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN2Q9UL51 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HCN2Q9UL51 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HCN2Q9UL51 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HCN2Q9UL51 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HCN2Q9UL51 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HCN2Q9UL51 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HCN2Q9UL51 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HCN2Q9UL51 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HCN2Q9UL51 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HCN2Q9UL51 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
HCN2Q9UL51 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HCN2Q9UL51 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HCN2Q9UL51 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HCN2Q9UL51 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HCN2Q9UL51 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HCN2Q9UL51 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HCN2Q9UL51 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HCN2Q9UL51 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HCN2Q9UL51 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HCN2Q9UL51 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HCN2Q9UL51 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HCN2Q9UL51 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HCN2Q9UL51 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HCN2Q9UL51 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
HCN2Q9UL51 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HCN2Q9UL51 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HCN2Q9UL51 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HCN2Q9UL51 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HCN2Q9UL51 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HCN2Q9UL51 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HCN2Q9UL51 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HCN2Q9UL51 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
HCN2Q9UL51 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HCN2Q9UL51 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HCN2Q9UL51 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HCN2Q9UL51 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HCN2Q9UL51 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HCN2Q9UL51 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HCN2Q9UL51 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HCN2Q9UL51 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HCN2Q9UL51 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
HCN2Q9UL51 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HCN2Q9UL51 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HCN2Q9UL51 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HCN2Q9UL51 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
HCN2Q9UL51 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
HCN2Q9UL51 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HCN2Q9UL51 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HCN2Q9UL51 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HCN2Q9UL51 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HCN2Q9UL51 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HCN2Q9UL51 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HCN2Q9UL51 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
HCN2Q9UL51 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HCN2Q9UL51 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HCN2Q9UL51 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HCN2Q9UL51 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HCN2Q9UL51 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HCN2Q9UL51 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HCN2Q9UL51 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HCN2Q9UL51 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HCN2Q9UL51 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HCN2Q9UL51 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HCN2Q9UL51 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HCN2Q9UL51 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HCN2Q9UL51 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HCN2Q9UL51 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HCN2Q9UL51 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HCN2Q9UL51 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HCN2Q9UL51 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HCN2Q9UL51 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HCN2Q9UL51 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HCN2Q9UL51 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HCN2Q9UL51 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HCN2Q9UL51 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HCN2Q9UL51 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HCN2Q9UL51 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HCN2Q9UL51 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HCN2Q9UL51 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HCN2Q9UL51 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HCN2Q9UL51 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HCN2Q9UL51 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HCN2Q9UL51 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HCN2Q9UL51 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HCN2Q9UL51 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HCN2Q9UL51 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
HCN2Q9UL51 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HCN2Q9UL51 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HCN2Q9UL51 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HCN2Q9UL51 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HCN2Q9UL51 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HCN2Q9UL51 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HCN2Q9UL51 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HCN2Q9UL51 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HCN2Q9UL51 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HCN2Q9UL51 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HCN2Q9UL51 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HCN2Q9UL51 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HCN2Q9UL51 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HCN2Q9UL51 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms