Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL33

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LQ9UL33 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAPPC2LQ9UL33 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAPPC2LQ9UL33 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAPPC2LQ9UL33 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAPPC2LQ9UL33 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAPPC2LQ9UL33 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAPPC2LQ9UL33 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAPPC2LQ9UL33 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAPPC2LQ9UL33 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAPPC2LQ9UL33 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAPPC2LQ9UL33 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRAPPC2LQ9UL33 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRAPPC2LQ9UL33 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRAPPC2LQ9UL33 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRAPPC2LQ9UL33 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRAPPC2LQ9UL33 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRAPPC2LQ9UL33 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRAPPC2LQ9UL33 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRAPPC2LQ9UL33 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRAPPC2LQ9UL33 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRAPPC2LQ9UL33 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRAPPC2LQ9UL33 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRAPPC2LQ9UL33 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAPPC2LQ9UL33 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAPPC2LQ9UL33 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAPPC2LQ9UL33 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAPPC2LQ9UL33 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAPPC2LQ9UL33 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAPPC2LQ9UL33 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAPPC2LQ9UL33 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAPPC2LQ9UL33 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAPPC2LQ9UL33 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAPPC2LQ9UL33 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAPPC2LQ9UL33 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAPPC2LQ9UL33 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAPPC2LQ9UL33 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAPPC2LQ9UL33 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAPPC2LQ9UL33 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAPPC2LQ9UL33 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAPPC2LQ9UL33 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAPPC2LQ9UL33 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAPPC2LQ9UL33 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAPPC2LQ9UL33 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAPPC2LQ9UL33 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAPPC2LQ9UL33 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAPPC2LQ9UL33 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAPPC2LQ9UL33 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAPPC2LQ9UL33 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAPPC2LQ9UL33 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAPPC2LQ9UL33 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAPPC2LQ9UL33 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAPPC2LQ9UL33 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAPPC2LQ9UL33 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAPPC2LQ9UL33 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAPPC2LQ9UL33 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAPPC2LQ9UL33 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAPPC2LQ9UL33 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAPPC2LQ9UL33 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAPPC2LQ9UL33 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAPPC2LQ9UL33 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAPPC2LQ9UL33 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAPPC2LQ9UL33 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAPPC2LQ9UL33 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAPPC2LQ9UL33 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAPPC2LQ9UL33 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAPPC2LQ9UL33 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAPPC2LQ9UL33 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAPPC2LQ9UL33 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAPPC2LQ9UL33 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAPPC2LQ9UL33 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAPPC2LQ9UL33 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAPPC2LQ9UL33 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAPPC2LQ9UL33 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAPPC2LQ9UL33 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAPPC2LQ9UL33 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAPPC2LQ9UL33 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAPPC2LQ9UL33 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAPPC2LQ9UL33 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAPPC2LQ9UL33 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAPPC2LQ9UL33 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAPPC2LQ9UL33 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAPPC2LQ9UL33 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAPPC2LQ9UL33 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAPPC2LQ9UL33 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAPPC2LQ9UL33 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAPPC2LQ9UL33 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAPPC2LQ9UL33 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAPPC2LQ9UL33 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAPPC2LQ9UL33 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAPPC2LQ9UL33 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAPPC2LQ9UL33 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAPPC2LQ9UL33 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAPPC2LQ9UL33 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAPPC2LQ9UL33 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAPPC2LQ9UL33 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRAPPC2LQ9UL33 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRAPPC2LQ9UL33 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms