Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL01

DSE, Dermatan-sulfate epimerase, humanhuman

Predictions only

Length 958 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSEQ9UL01 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DSEQ9UL01 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DSEQ9UL01 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DSEQ9UL01 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DSEQ9UL01 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DSEQ9UL01 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DSEQ9UL01 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
DSEQ9UL01 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DSEQ9UL01 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DSEQ9UL01 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DSEQ9UL01 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DSEQ9UL01 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DSEQ9UL01 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DSEQ9UL01 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DSEQ9UL01 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DSEQ9UL01 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DSEQ9UL01 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DSEQ9UL01 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DSEQ9UL01 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DSEQ9UL01 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DSEQ9UL01 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DSEQ9UL01 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DSEQ9UL01 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DSEQ9UL01 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
DSEQ9UL01 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DSEQ9UL01 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DSEQ9UL01 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DSEQ9UL01 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DSEQ9UL01 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DSEQ9UL01 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DSEQ9UL01 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DSEQ9UL01 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DSEQ9UL01 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
DSEQ9UL01 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
DSEQ9UL01 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DSEQ9UL01 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DSEQ9UL01 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
DSEQ9UL01 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
DSEQ9UL01 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
DSEQ9UL01 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
DSEQ9UL01 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
DSEQ9UL01 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
DSEQ9UL01 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
DSEQ9UL01 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
DSEQ9UL01 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
DSEQ9UL01 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
DSEQ9UL01 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
DSEQ9UL01 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
DSEQ9UL01 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
DSEQ9UL01 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
DSEQ9UL01 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DSEQ9UL01 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
DSEQ9UL01 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DSEQ9UL01 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
DSEQ9UL01 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
DSEQ9UL01 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DSEQ9UL01 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
DSEQ9UL01 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DSEQ9UL01 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
DSEQ9UL01 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
DSEQ9UL01 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
DSEQ9UL01 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DSEQ9UL01 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DSEQ9UL01 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DSEQ9UL01 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DSEQ9UL01 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
DSEQ9UL01 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DSEQ9UL01 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
DSEQ9UL01 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
DSEQ9UL01 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
DSEQ9UL01 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DSEQ9UL01 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
DSEQ9UL01 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DSEQ9UL01 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
DSEQ9UL01 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DSEQ9UL01 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
DSEQ9UL01 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
DSEQ9UL01 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
DSEQ9UL01 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DSEQ9UL01 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
DSEQ9UL01 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DSEQ9UL01 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
DSEQ9UL01 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
DSEQ9UL01 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DSEQ9UL01 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DSEQ9UL01 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DSEQ9UL01 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DSEQ9UL01 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
DSEQ9UL01 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DSEQ9UL01 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
DSEQ9UL01 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DSEQ9UL01 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
DSEQ9UL01 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
DSEQ9UL01 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DSEQ9UL01 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DSEQ9UL01 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
DSEQ9UL01 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DSEQ9UL01 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DSEQ9UL01 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DSEQ9UL01 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 142.6 ms