Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKK3

PARP4, Poly [ADP-ribose] polymerase 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP4Q9UKK3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
PARP4Q9UKK3 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PARP4Q9UKK3 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PARP4Q9UKK3 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
PARP4Q9UKK3 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PARP4Q9UKK3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PARP4Q9UKK3 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PARP4Q9UKK3 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PARP4Q9UKK3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PARP4Q9UKK3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PARP4Q9UKK3 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PARP4Q9UKK3 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PARP4Q9UKK3 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PARP4Q9UKK3 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
PARP4Q9UKK3 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PARP4Q9UKK3 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PARP4Q9UKK3 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PARP4Q9UKK3 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC29.84■■■□□ 2.37
PARP4Q9UKK3 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
PARP4Q9UKK3 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
PARP4Q9UKK3 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PARP4Q9UKK3 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
PARP4Q9UKK3 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
PARP4Q9UKK3 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PARP4Q9UKK3 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PARP4Q9UKK3 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
PARP4Q9UKK3 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PARP4Q9UKK3 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
PARP4Q9UKK3 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
PARP4Q9UKK3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PARP4Q9UKK3 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PARP4Q9UKK3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PARP4Q9UKK3 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
PARP4Q9UKK3 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
PARP4Q9UKK3 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PARP4Q9UKK3 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PARP4Q9UKK3 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PARP4Q9UKK3 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PARP4Q9UKK3 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PARP4Q9UKK3 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PARP4Q9UKK3 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
PARP4Q9UKK3 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PARP4Q9UKK3 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PARP4Q9UKK3 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PARP4Q9UKK3 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PARP4Q9UKK3 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PARP4Q9UKK3 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
PARP4Q9UKK3 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PARP4Q9UKK3 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PARP4Q9UKK3 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
PARP4Q9UKK3 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PARP4Q9UKK3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PARP4Q9UKK3 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PARP4Q9UKK3 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PARP4Q9UKK3 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PARP4Q9UKK3 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
PARP4Q9UKK3 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PARP4Q9UKK3 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PARP4Q9UKK3 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PARP4Q9UKK3 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PARP4Q9UKK3 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PARP4Q9UKK3 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PARP4Q9UKK3 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
PARP4Q9UKK3 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PARP4Q9UKK3 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PARP4Q9UKK3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PARP4Q9UKK3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PARP4Q9UKK3 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PARP4Q9UKK3 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PARP4Q9UKK3 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
PARP4Q9UKK3 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PARP4Q9UKK3 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PARP4Q9UKK3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PARP4Q9UKK3 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PARP4Q9UKK3 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PARP4Q9UKK3 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PARP4Q9UKK3 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PARP4Q9UKK3 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PARP4Q9UKK3 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PARP4Q9UKK3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PARP4Q9UKK3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PARP4Q9UKK3 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PARP4Q9UKK3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
PARP4Q9UKK3 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
PARP4Q9UKK3 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
PARP4Q9UKK3 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PARP4Q9UKK3 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PARP4Q9UKK3 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PARP4Q9UKK3 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PARP4Q9UKK3 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PARP4Q9UKK3 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PARP4Q9UKK3 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PARP4Q9UKK3 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PARP4Q9UKK3 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
PARP4Q9UKK3 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
PARP4Q9UKK3 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
PARP4Q9UKK3 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.36
PARP4Q9UKK3 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
PARP4Q9UKK3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
PARP4Q9UKK3 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms