Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK28

TMEM59L, Transmembrane protein 59-like, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM59LQ9UK28 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMEM59LQ9UK28 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMEM59LQ9UK28 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMEM59LQ9UK28 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMEM59LQ9UK28 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMEM59LQ9UK28 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMEM59LQ9UK28 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMEM59LQ9UK28 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMEM59LQ9UK28 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMEM59LQ9UK28 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMEM59LQ9UK28 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMEM59LQ9UK28 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TMEM59LQ9UK28 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TMEM59LQ9UK28 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TMEM59LQ9UK28 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TMEM59LQ9UK28 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TMEM59LQ9UK28 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TMEM59LQ9UK28 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TMEM59LQ9UK28 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TMEM59LQ9UK28 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TMEM59LQ9UK28 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TMEM59LQ9UK28 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TMEM59LQ9UK28 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TMEM59LQ9UK28 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TMEM59LQ9UK28 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TMEM59LQ9UK28 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TMEM59LQ9UK28 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TMEM59LQ9UK28 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TMEM59LQ9UK28 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TMEM59LQ9UK28 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TMEM59LQ9UK28 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TMEM59LQ9UK28 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMEM59LQ9UK28 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMEM59LQ9UK28 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMEM59LQ9UK28 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMEM59LQ9UK28 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMEM59LQ9UK28 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMEM59LQ9UK28 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMEM59LQ9UK28 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
TMEM59LQ9UK28 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMEM59LQ9UK28 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMEM59LQ9UK28 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMEM59LQ9UK28 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMEM59LQ9UK28 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMEM59LQ9UK28 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMEM59LQ9UK28 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMEM59LQ9UK28 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
TMEM59LQ9UK28 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMEM59LQ9UK28 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMEM59LQ9UK28 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMEM59LQ9UK28 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMEM59LQ9UK28 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMEM59LQ9UK28 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMEM59LQ9UK28 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMEM59LQ9UK28 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMEM59LQ9UK28 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMEM59LQ9UK28 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMEM59LQ9UK28 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
TMEM59LQ9UK28 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMEM59LQ9UK28 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMEM59LQ9UK28 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMEM59LQ9UK28 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMEM59LQ9UK28 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMEM59LQ9UK28 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMEM59LQ9UK28 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMEM59LQ9UK28 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMEM59LQ9UK28 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMEM59LQ9UK28 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMEM59LQ9UK28 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
TMEM59LQ9UK28 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMEM59LQ9UK28 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMEM59LQ9UK28 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMEM59LQ9UK28 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
TMEM59LQ9UK28 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
TMEM59LQ9UK28 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMEM59LQ9UK28 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
TMEM59LQ9UK28 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMEM59LQ9UK28 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMEM59LQ9UK28 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMEM59LQ9UK28 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMEM59LQ9UK28 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMEM59LQ9UK28 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMEM59LQ9UK28 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
TMEM59LQ9UK28 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMEM59LQ9UK28 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMEM59LQ9UK28 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMEM59LQ9UK28 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMEM59LQ9UK28 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMEM59LQ9UK28 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMEM59LQ9UK28 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
TMEM59LQ9UK28 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMEM59LQ9UK28 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMEM59LQ9UK28 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMEM59LQ9UK28 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMEM59LQ9UK28 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMEM59LQ9UK28 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMEM59LQ9UK28 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMEM59LQ9UK28 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMEM59LQ9UK28 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMEM59LQ9UK28 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms